মিউটেশনাল স্বাক্ষর: টিউমারের ইতিহাস পড়া

কিভাবে একটি স্বাক্ষর সংজ্ঞায়িত করা হয়

সর্বাধিক প্রতিষ্ঠিত ফ্রেমওয়ার্ক প্রতিটি একক-বেস প্রতিস্থাপনকে পরিবর্তন (উদাহরণস্বরূপ C>T) এবং ফ্ল্যাঙ্কিং বেস দ্বারা শ্রেণীবদ্ধ করে, 96টি বিভাগ দেয়। বৃহৎ প্যান-ক্যান্সার ডেটাসেটগুলিকে গাণিতিকভাবে রেফারেন্স স্বাক্ষরের একটি সেটে ফ্যাক্টরাইজ করা হয়েছিল, প্রতিটি 96টি বিভাগে সম্ভাব্যতা বিতরণ।

ছোট সন্নিবেশ এবং মুছে ফেলার জন্য এবং কাঠামোগত পুনর্বিন্যাসের জন্য অতিরিক্ত ক্যাটালগ বিদ্যমান। কিছু রেফারেন্স স্বাক্ষর একটি পরিচিত কারণ আছে; অন্যরা অজানা অ্যাটিওলজি থেকে যায়।

কি স্বাক্ষর সুপারিশ করতে পারে

একটি প্রভাবশালী UV স্বাক্ষর সূর্যের এক্সপোজার নির্দেশ করে; ধূমপান-সম্পর্কিত mutagenesis একটি তামাক স্বাক্ষর; মাইক্রোহোমোলজিতে হোমোলগাস রিকম্বিনেশন ডেফিসিয়েন্সিতে অনেক ছোট মুছে ফেলার স্বাক্ষর; APOBEC কার্যকলাপে একটি TpC-প্রসঙ্গ স্বাক্ষর।

সময়ের সাথে স্বাক্ষরগুলি জমা হয়, তাই একটি টিউমার জিনোম একটি মিশ্রণ বহন করে যা তার পুরো ইতিহাসকে প্রতিফলিত করে, সেই প্রক্রিয়াগুলি সহ যা আগে সক্রিয় ছিল এবং এখন নীরব।

ব্যাখ্যামূলক সীমা

স্বাক্ষর ফিটিং একটি পরিসংখ্যানগত অনুমান। কম মিউটেশন গণনা, পুরো জিনোমের পরিবর্তে লক্ষ্যযুক্ত প্যানেল, সিকোয়েন্সিং প্রত্নবস্তু এবং ঘনিষ্ঠভাবে সম্পর্কিত রেফারেন্স স্বাক্ষর সবই আত্মবিশ্বাস হ্রাস করে।

একটি মেরামত ত্রুটির সাথে যুক্ত একটি স্বাক্ষর সহায়ক প্রমাণ, একটি কার্যকরী পরীক্ষা নয়, এবং সনাক্ত করা প্রকৃত বৈকল্পিক এবং ক্লিনিকাল প্রসঙ্গের পাশাপাশি পড়া উচিত।

স্বাক্ষর থেকে অ্যাকশন পর্যন্ত

একটি সংখ্যালঘু স্বাক্ষর বর্তমানে সরাসরি ক্লিনিকাল ওজন বহন করে। সমজাতীয়-পুনঃসংযোগ-ঘাটতি এবং অমিল-মেরামত স্বাক্ষরগুলি চিকিত্সার সিদ্ধান্তগুলিকে সমর্থন করতে পারে যা সাধারণত উত্সর্গীকৃত অ্যাসেগুলিতে করা হয় এবং একটি প্রুফরিডিং বা APOBEC স্বাক্ষর একটি অপ্রত্যাশিতভাবে উচ্চ মিউটেশন গণনা ব্যাখ্যা করতে সহায়তা করে। বেশিরভাগ অন্যান্য স্বাক্ষর বর্ণনামূলক।

ব্যবহারিক নিয়ম হল যে একটি স্বাক্ষরকে শক্তিশালী করে বা চ্যালেঞ্জ করে অন্য উপায়ে প্রাপ্ত ফলাফল। এটি খুব কমই একটি থেরাপির ভিত্তি হিসাবে একা দাঁড়িয়ে থাকে এবং একটি দুর্বল বা প্যানেল থেকে প্রাপ্ত স্বাক্ষর কলকে সতর্কতার সাথে চিকিত্সা করা উচিত।

কী টেকওয়েজ

• ·মিউটেশনাল সিগনেচার হল প্রসঙ্গ-নির্দিষ্ট প্যাটার্ন যা স্বতন্ত্র মিউটেশনাল প্রক্রিয়া দ্বারা বাকী থাকে।
• ·তারা ইউভি বা তামাকের মতো এক্সপোজার বা এইচআরডি বা প্রুফরিডিং ক্ষতির মতো ত্রুটিগুলিকে জড়িত করতে পারে।
• ·স্বাক্ষর বিশ্লেষণ হল একটি সম্ভাব্য অনুমান যা পরখের প্রস্থ এবং মিউটেশন গণনার উপর ব্যাপকভাবে নির্ভর করে।