ARID1A এবং SWI/SNF কমপ্লেক্স: ক্যান্সারে ক্রোমাটিন রিমডেলিং
SWI/SNF কমপ্লেক্স, যাকে BAFও বলা হয়, নিউক্লিওসোমগুলিকে স্লাইড করতে এবং উচ্ছেদ করতে শক্তি ব্যবহার করে যাতে DNA ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টরগুলিতে অ্যাক্সেসযোগ্য হয়ে ওঠে। এর সাবইউনিটগুলি, বিশেষ করে ARID1A, সমস্ত মানব ক্যান্সারের প্রায় 20 শতাংশে সম্মিলিতভাবে পরিবর্তিত হয়, যা ক্রোমাটিন রিমডেলিংকে ক্যান্সারের সবচেয়ে সাধারণভাবে ব্যাহত প্রক্রিয়াগুলির মধ্যে একটি করে তোলে।
দ্রুত উত্তর
SWI/SNF কমপ্লেক্স, যাকে BAFও বলা হয়, নিউক্লিওসোমগুলিকে স্লাইড করতে এবং উচ্ছেদ করতে শক্তি ব্যবহার করে যাতে DNA ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টরগুলিতে অ্যাক্সেসযোগ্য হয়ে ওঠে। এর সাবইউনিটগুলি, বিশেষ করে ARID1A, সমস্ত মানব ক্যান্সারের প্রায় 20 শতাংশে সম্মিলিতভাবে পরিবর্তিত হয়, যা ক্রোমাটিন রিমডেলিংকে ক্যান্সারের সবচেয়ে সাধারণভাবে ব্যাহত প্রক্রিয়াগুলির মধ্যে একটি করে তোলে।
SWI/SNF কি করে
ডিএনএ নিউক্লিওসোম গঠনের জন্য হিস্টোন অক্টেমারের চারপাশে আবৃত থাকে, যা ডিফল্টভাবে নিয়ন্ত্রক ক্রমগুলিতে অ্যাক্সেস ব্লক করে। SWI/SNF কমপ্লেক্স তার অনুঘটক সাবুনিটের (SMARCA4 বা SMARCA2) মাধ্যমে ATP হাইড্রোলাইজ করে প্রোমোটার এবং বর্ধকদের নিউক্লিওসোমগুলিকে পুনঃস্থাপন বা অপসারণ করতে।
এটি বংশ-নির্দিষ্ট জিনের অভিব্যক্তি, পার্থক্য এবং কিছু প্রসঙ্গে, টিউমার-দমনকারী প্রোগ্রাম এবং ডিএনএ মেরামতের কার্যকলাপের জন্য অপরিহার্য করে তোলে।
টিউমার দমনকারী হিসাবে ARID1A
ARID1A হল একটি ডিএনএ-বাইন্ডিং সাবইউনিট যা নির্দিষ্ট সাইটে কমপ্লেক্সকে টার্গেট করতে সাহায্য করে। লস-অফ-ফাংশন ARID1A মিউটেশনগুলি হল সবচেয়ে সাধারণ SWI/SNF ক্ষত এবং ডিম্বাশয় পরিষ্কার কোষ এবং এন্ডোমেট্রিয়েড কার্সিনোমা, এন্ডোমেট্রিয়াল ক্যান্সার, গ্যাস্ট্রিক ক্যান্সার, মূত্রাশয় ক্যান্সার এবং কোলাঞ্জিওকার্সিনোমাতে পুনরাবৃত্তি হয়।
বেশিরভাগ ARID1A মিউটেশনগুলি কেটে যায় এবং প্রোটিনের ক্ষতির দিকে পরিচালিত করে, যা ইমিউনোহিস্টোকেমিস্ট্রি দ্বারা সনাক্ত করা যায় এবং কিছু টিউমারে ডায়াগনস্টিকভাবে ব্যবহৃত হয়।
অন্যান্য সাবুনিট এবং স্বতন্ত্র ক্যান্সার
SMARCB1 ক্ষতি ম্যালিগন্যান্ট র্যাবডয়েড টিউমার এবং এপিথেলিয়ড সারকোমাকে সংজ্ঞায়িত করে। SMARCA4 ক্ষতি ডিম্বাশয়ের হাইপারক্যালসেমিক ধরণের ছোট কোষের কার্সিনোমা এবং আক্রমনাত্মক থোরাসিক টিউমারের একটি উপসেট চালায়। ক্লিয়ার সেল রেনাল সেল কার্সিনোমাতে PBRM1 ক্ষতি সাধারণ।
প্রতিটি সাবইউনিটের ক্ষতি একটি বৈশিষ্ট্যযুক্ত টিউমার বর্ণালী তৈরি করে, তাই নির্দিষ্ট জিন গুরুত্বপূর্ণ।
উদীয়মান দুর্বলতা
SWI/SNF-মিউট্যান্ট ক্যান্সারগুলি অবশিষ্ট জটিল কার্যকলাপ বা ক্ষতিপূরণের পথের উপর নির্ভর করতে পারে। ARID1A-এর ঘাটতি কোষগুলি প্যারালোগ ARID1B, EZH2 ইনহিবিটর, কিছু মডেলের PARP এবং ATR ইনহিবিটরগুলির প্রতি সংবেদনশীলতা দেখায় এবং ইমিউন-চেকপয়েন্ট অবরোধে পরিবর্তিত প্রতিক্রিয়া দেখায়।
SMARCB1- বা SMARCA4-ঘাটতি টিউমারগুলিকে EZH2 ইনহিবিটর দিয়ে চিকিত্সা করা হচ্ছে, এপিথেলিয়ড সারকোমার জন্য অনুমোদিত ট্যাজেমেটোস্ট্যাট। অধিকাংশ অন্যান্য পন্থা তদন্ত রয়ে গেছে.
ব্যাখ্যামূলক নোট
একটি SWI/SNF সাবইউনিট পরিবর্তনকে বিশেষভাবে চিহ্নিত করা উচিত (ARID1A বনাম SMARCB1 বনাম SMARCA4 এবং আরও অনেক কিছু), কারণ টিউমার সমিতি এবং যে কোনও থেরাপিউটিক লিডগুলি আলাদা।
ইমিউনোহিস্টোকেমিস্ট্রি দ্বারা সাবুনিট প্রোটিনের ক্ষতি কার্যকরী নিষ্ক্রিয়তাকে সমর্থন করে, অনুক্রমের পরিপূরক।
কী টেকওয়েজ
- ·SWI/SNF (BAF) এটিপি ব্যবহার করে নিউক্লিওসোমগুলিকে প্রতিস্থাপন করতে এবং নিয়ন্ত্রক ডিএনএ খোলার জন্য।
- ·প্রায় 20 শতাংশ ক্যান্সারে এর সাবইউনিটগুলি সম্মিলিতভাবে পরিবর্তিত হয়; ARID1A ক্ষতি সবচেয়ে সাধারণ।
- ·বিভিন্ন সাবইউনিটের ক্ষতি (SMARCB1, SMARCA4, PBRM1) বিভিন্ন ধরনের টিউমারকে সংজ্ঞায়িত করে।
- ·সিন্থেটিক-মারাত্মক সীসাগুলির মধ্যে রয়েছে EZH2, ARID1B এবং DNA-ক্ষতি-প্রতিক্রিয়া লক্ষ্যবস্তু, বেশিরভাগই তদন্তমূলক।
এই জিনগুলিকে পথের প্রসঙ্গে রাখুন
প্রায়শই জিজ্ঞাসিত প্রশ্ন
ARID1A এবং SWI/SNF কমপ্লেক্সের মূল ধারণা কী: ক্যান্সারে ক্রোমাটিন রিমডেলিং?
SWI/SNF কমপ্লেক্স, যাকে BAFও বলা হয়, নিউক্লিওসোমগুলিকে স্লাইড করতে এবং উচ্ছেদ করতে শক্তি ব্যবহার করে যাতে DNA ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টরগুলিতে অ্যাক্সেসযোগ্য হয়ে ওঠে। এর সাবইউনিটগুলি, বিশেষ করে ARID1A, সমস্ত মানব ক্যান্সারের প্রায় 20 শতাংশে সম্মিলিতভাবে পরিবর্তিত হয়, যা ক্রোমাটিন রিমডেলিংকে ক্যান্সারের সবচেয়ে সাধারণভাবে ব্যাহত প্রক্রিয়াগুলির মধ্যে একটি করে তোলে।
রেজাল্ট বা মেকানিজমের সাথে কি রাখতে হবে?
প্রায় 20 শতাংশ ক্যান্সারে এর সাবইউনিটগুলি সম্মিলিতভাবে পরিবর্তিত হয়; ARID1A ক্ষতি সবচেয়ে সাধারণ। বিভিন্ন সাবুনিটের ক্ষতি (SMARCB1, SMARCA4, PBRM1) বিভিন্ন টিউমারের ধরণকে সংজ্ঞায়িত করে। সিন্থেটিক-প্রাণঘাতী লিডগুলির মধ্যে রয়েছে EZH2, ARID1B এবং DNA-ক্ষতি-প্রতিক্রিয়া লক্ষ্যবস্তু, বেশিরভাগই তদন্তমূলক।
তথ্যসূত্র
পড়া চালিয়ে যান
KMT2D এবং KMT2C: অনেক ক্যান্সারে এনহ্যান্সার রেগুলেটর হারিয়ে গেছে
3 মিনিট পড়া হয়েছে
এটিএম বনাম এটিআর: দুটি ডিএনএ-ড্যামেজ রেসপন্স কিনসেস
2 মিনিট পড়া
শীর্ষ টিউমার দমনকারী জিন ব্যাখ্যা করা হয়েছে
6 মিনিট পড়া হয়েছে
অনিশ্চিত তাৎপর্যের বৈকল্পিক: কিভাবে একটি VUS ফলাফল পড়তে হয়
2 মিনিট পড়া
CDKN2A এবং MTAP সহ-মোছা: 9p21 অঞ্চল বোঝা
2 মিনিট পড়া
SMARCB1 ক্ষতি এবং Rhabdoid টিউমার
3 মিনিট পড়া হয়েছে
আপনার পরবর্তী গবেষণা পদক্ষেপ চয়ন করুন
এই ব্যাখ্যা থেকে একটি জিন প্রোফাইল, একটি পথের মানচিত্র, বা পরবর্তী প্রমাণ আপডেটে সরান।
TP53 আছে 100+ বর্তমানে ClinicalTrials.gov-এ নিয়োগের পরীক্ষা চলছে। GeneAnalyses ডাইজেস্ট প্রতিদিন নতুন এবং পরিবর্তিতগুলিকে সংক্ষিপ্ত করে৷