এইচএলএ হেটেরোজাইগোসিটির ক্ষতি: হাফ দ্য প্রেজেন্টেশন রিপারটোয়ার হারানো
মানব জিনোমে এইচএলএ ক্লাস I জিনগুলি সবচেয়ে পলিমরফিক, এবং বেশিরভাগ লোকেরা প্রতিটি পিতামাতার কাছ থেকে বিভিন্ন অ্যালিল উত্তরাধিকার সূত্রে পায়। টিউমারগুলি এইচএলএ লোকাসে একটি প্যারেন্টাল হ্যাপ্লোটাইপ মুছে ফেলতে পারে, এটি হেটেরোজাইগোসিটির ক্ষতির একটি রূপ যা MHC ক্লাস I সম্পূর্ণরূপে বাতিল না করে অর্ধেক পর্যন্ত অ্যান্টিজেন-প্রেজেন্টেশন রিপারটোয়ারকে সরিয়ে দেয়।
দ্রুত উত্তর
মানব জিনোমে এইচএলএ ক্লাস I জিনগুলি সবচেয়ে পলিমরফিক, এবং বেশিরভাগ লোকেরা প্রতিটি পিতামাতার কাছ থেকে বিভিন্ন অ্যালিল উত্তরাধিকার সূত্রে পায়। টিউমারগুলি এইচএলএ লোকাসে একটি প্যারেন্টাল হ্যাপ্লোটাইপ মুছে ফেলতে পারে, এটি হেটেরোজাইগোসিটির ক্ষতির একটি রূপ যা MHC ক্লাস I সম্পূর্ণরূপে বাতিল না করে অর্ধেক পর্যন্ত অ্যান্টিজেন-প্রেজেন্টেশন রিপারটোয়ারকে সরিয়ে দেয়।
একটি বিষয় ক্লাস্টার অংশ
ইমিউনো-অনকোলজি এবং টিউমার মেটাবলিজম
সম্পূর্ণ 15-নিবন্ধ গাইড খুলুনমোট ক্ষতির চেয়ে একটি সূক্ষ্ম পালানো
একটি এইচএলএ হ্যাপ্লোটাইপ রাখা টিউমার কোষকে কিছু অ্যান্টিজেন উপস্থাপনা বজায় রাখতে দেয়, প্রাকৃতিক হত্যাকারী কোষ আক্রমণ এড়াতে যা সম্পূর্ণ MHC ক্লাস I ক্ষতি অনুসরণ করে, মুছে ফেলা অ্যালিলে সীমাবদ্ধ যে কোনও নিওঅ্যান্টিজেন উপস্থাপন করার ক্ষমতা বাদ দেয়।
একটি ফুসফুসের ক্যান্সারের গবেষণায়, HLA হেটেরোজাইগোসিটির ক্ষতি টিউমারের একটি বৃহৎ অংশে উপস্থিত ছিল এবং প্রায়শই সাবক্লোনাল ছিল, যা ইঙ্গিত করে যে এটি একটি একক প্রাথমিক ঘটনার পরিবর্তে ইমিউন চাপের সাথে চলমান অভিযোজন।
কেন মিস করা সহজ
স্ট্যান্ডার্ড কপি-সংখ্যার সরঞ্জামগুলি এইচএলএ লোকাসে লড়াই করে কারণ অঞ্চলটি অত্যন্ত বহুরূপী এবং বিভিন্ন জিনের ক্রম একই রকম। অ্যালিল-নির্দিষ্ট ক্ষতিকে নির্ভরযোগ্যভাবে কল করার জন্য রোগীর জীবাণু এইচএলএ টাইপ ব্যবহার করে এমন ডেডিকেটেড অ্যালগরিদম প্রয়োজন।
এর মানে এইচএলএ হেটেরোজাইগোসিটির ক্ষতি হতে পারে কিন্তু একটি রুটিন টিউমার প্যানেল দ্বারা রিপোর্ট করা হয়নি।
নিওঅ্যান্টিজেন ভবিষ্যদ্বাণীর পরিণতি
নিওঅ্যান্টিজেন ভবিষ্যদ্বাণী পাইপলাইন অনুমান করে যে একটি টিউমার একজন ব্যক্তির সমস্ত এইচএলএ অ্যালিলে পেপটাইড উপস্থাপন করতে পারে। যদি একটি হ্যাপ্লোটাইপ মুছে ফেলা হয়, তবে সেই অ্যালিলের বিরুদ্ধে ভবিষ্যদ্বাণীগুলি অমূলক, এবং টিউমারের প্রকৃত উপস্থাপনযোগ্য ভাণ্ডার এটি প্রদর্শিত হওয়ার চেয়ে ছোট।
HLA ক্ষতির জন্য অ্যাকাউন্টিং পূর্বাভাসিত ইমিউনোজেনিসিটি এবং প্রকৃত অনাক্রম্য চাপের মধ্যে পারস্পরিক সম্পর্ককে উন্নত করে, কিন্তু এই পরিমার্জনটি এখন পর্যন্ত বেশিরভাগই একটি গবেষণা কৌশল।
যেখানে এটি অনুশীলনে বসে
এইচএলএ হেটেরোজাইগোসিটির ক্ষতির জন্য রুটিন অনকোলজিতে পরীক্ষা করা হয় না, এবং এটির উপর কোন চিকিত্সা নির্বাচন করা হয় না। এর প্রধান মান ব্যাখ্যামূলক: এটি একটি কারণ একটি উচ্চ পূর্বাভাসিত নিওঅ্যান্টিজেন লোড এবং দৃশ্যমান টি-সেল অনুপ্রবেশ সহ একটি টিউমার এখনও অনাক্রম্যতা এড়াতে পারে এবং একটি চেকপয়েন্ট ইনহিবিটারকে ব্যর্থ করতে পারে।
নিওঅ্যান্টিজেন-নির্দেশিত ট্রায়ালগুলির জন্য এটি আরও গুরুত্বপূর্ণ, কারণ একটি ভ্যাকসিন বা টি-সেল পণ্য যা একটি পেপটাইডের উদ্দেশ্যে সীমাবদ্ধ একটি মুছে ফেলা অ্যালিলে নিষ্ক্রিয় হবে। গবেষণা পাইপলাইনগুলি এই কারণে ক্রমবর্ধমানভাবে অ্যালিল-নির্দিষ্ট এইচএলএ কলিংকে অন্তর্ভুক্ত করে, এবং একই তথ্য ব্যাখ্যা করতে সাহায্য করে কেন টিউমারের মধ্যে অনাক্রম্য চাপ অসম।
কী টেকওয়েজ
- ·এইচএলএ হেটেরোজাইগোসিটির ক্ষতি একটি প্যারেন্টাল এইচএলএ হ্যাপ্লোটাইপ মুছে দেয়, অ্যান্টিজেন উপস্থাপনাকে সংকুচিত করে।
- ·এটি আংশিক MHC ক্লাস I ধরে রাখে, প্রাকৃতিক হত্যাকারী কোষের আক্রমণ এড়ায় এবং প্রায়ই সাবক্লোনাল হয়।
- ·এর জন্য বিশেষায়িত সনাক্তকরণের প্রয়োজন হয় এবং উপস্থিত হলে, টিউমারের প্রকৃত নিওঅ্যান্টিজেন সংগ্রহস্থলকে সঙ্কুচিত করে।
এই জিনগুলিকে পথের প্রসঙ্গে রাখুন
প্রায়শই জিজ্ঞাসিত প্রশ্ন
HLA হেটেরোজাইগোসিটির ক্ষতি কীভাবে B2M ক্ষতি থেকে আলাদা?
B2M ক্ষতি সমস্ত MHC ক্লাস I সরিয়ে দেয়; হেটেরোজাইগোসিটির এইচএলএ ক্ষতি একটি প্যারেন্টাল হ্যাপ্লোটাইপ মুছে দেয়, আংশিক উপস্থাপনা বজায় রাখে, প্রাকৃতিক হত্যাকারী কোষের আক্রমণ এড়ায় এবং হারিয়ে যাওয়া অ্যালিলে সীমাবদ্ধ নিওঅ্যান্টিজেনগুলিকে ফেলে দেয়।
কেন একটি নিয়মিত টিউমার প্যানেল এটি মিস করতে পারে?
এইচএলএ অঞ্চলটি অত্যন্ত বহুরূপী এবং জিনগুলি ক্রমানুসারে একই রকম, তাই স্ট্যান্ডার্ড কপি-সংখ্যার সরঞ্জামগুলি সেখানে লড়াই করে। ডেডিকেটেড অ্যালগরিদম যেগুলি রোগীর জীবাণু এইচএলএ টাইপ ব্যবহার করে তা নির্ভরযোগ্যভাবে কল করার জন্য প্রয়োজন।
এটি কি নিওঅ্যান্টিজেন পূর্বাভাসকে প্রভাবিত করে?
হ্যাঁ। ভবিষ্যদ্বাণী পাইপলাইন অনুমান করে যে একজন ব্যক্তির সমস্ত এইচএলএ অ্যালিল উপলব্ধ; যদি একটি হ্যাপ্লোটাইপ মুছে ফেলা হয়, তাহলে টিউমারের প্রকৃত উপস্থাপনযোগ্য ভাণ্ডার পূর্বাভাসের চেয়ে ছোট।
তথ্যসূত্র
- 1ফুসফুসের ক্যান্সারের বিবর্তনে অ্যালিল-নির্দিষ্ট এইচএলএ ক্ষতি এবং রোগ প্রতিরোধ ক্ষমতা. সেল, 2017. PubMed
- 2প্যান-ক্যান্সার ইমিউনোজেনোমিক বিশ্লেষণ জিনোটাইপ-ইমিউনোফেনোটাইপ সম্পর্ক এবং চেকপয়েন্ট অবরোধের প্রতিক্রিয়ার ভবিষ্যদ্বাণী প্রকাশ করে. সেল প্রতিনিধি, 2017. PubMed
- 3ক্যান্সার ইমিউনোথেরাপিতে বায়োমার্কার হিসাবে টিউমার মিউটেশনাল বোঝা. ন্যাট রেভ ক্লিন অনকল, 2019. PubMed
পড়া চালিয়ে যান
B2M এবং MHC ক্লাস I ক্ষতি: টি কোষ থেকে লুকানো
3 মিনিট পড়া হয়েছে
নিওঅ্যান্টিজেন এবং টিউমার ইমিউনোজেনিসিটি
3 মিনিট পড়া হয়েছে
JAK1/JAK2 ক্ষতি এবং ইমিউনোথেরাপিতে ইন্টারফেরন-সিগন্যালিং প্রতিরোধ
3 মিনিট পড়া হয়েছে
অনুলিপি-সংখ্যা পরিবর্তনগুলি ব্যাখ্যা করা: পরিবর্ধন, লাভ, ক্ষতি এবং মুছে ফেলা
3 মিনিট পড়া হয়েছে
PD-L1 টেস্টিং ব্যাখ্যা করা হয়েছে: অ্যাসেস, স্কোর এবং সীমা
2 মিনিট পড়া
গরম বনাম ঠান্ডা টিউমার: টি-সেল অনুপ্রবেশ মানে কি
3 মিনিট পড়া হয়েছে
আপনার পরবর্তী গবেষণা পদক্ষেপ চয়ন করুন
এই ব্যাখ্যা থেকে একটি জিন প্রোফাইল, একটি পথের মানচিত্র, বা পরবর্তী প্রমাণ আপডেটে সরান।
STAT3 আছে 20+ বর্তমানে ClinicalTrials.gov-এ নিয়োগের পরীক্ষা চলছে। GeneAnalyses ডাইজেস্ট প্রতিদিন নতুন এবং পরিবর্তিতগুলিকে সংক্ষিপ্ত করে৷