এনজিএস প্যানেল বনাম হটস্পট টেস্টিং: ব্রেডথ বনাম ফোকাস
আণবিক পরীক্ষার রেঞ্জ ছোট ছোট অ্যাসেস থেকে শুরু করে যা কয়েকশত জিনকে কভার করে বড় পরবর্তী প্রজন্মের সিকোয়েন্সিং প্যানেল পর্যন্ত পরিচিত মিউটেশন অবস্থানের একটি মুষ্টিমেয় পরীক্ষা করে। পছন্দ কি পাওয়া যাবে, কত দ্রুত এবং কিভাবে নেতিবাচক ফলাফল পড়তে হবে তা প্রভাবিত করে।
দ্রুত উত্তর
আণবিক পরীক্ষার রেঞ্জ ছোট ছোট অ্যাসেস থেকে শুরু করে যা কয়েকশত জিনকে কভার করে বড় পরবর্তী প্রজন্মের সিকোয়েন্সিং প্যানেল পর্যন্ত পরিচিত মিউটেশন অবস্থানের একটি মুষ্টিমেয় পরীক্ষা করে। পছন্দ কি পাওয়া যাবে, কত দ্রুত এবং কিভাবে নেতিবাচক ফলাফল পড়তে হবে তা প্রভাবিত করে।
হটস্পট অ্যাসেস
হটস্পট পরীক্ষা, প্রায়শই পিসিআর-ভিত্তিক, পুনরাবৃত্ত মিউটেশন অবস্থানের একটি সংজ্ঞায়িত তালিকা জিজ্ঞাসাবাদ করে, উদাহরণস্বরূপ EGFR এক্সন 19 মুছে ফেলা, L858R এবং T790M, বা KRAS কোডন 12 এবং 13 পরিবর্তন। এগুলি দ্রুত, সস্তা, কম ইনপুটে সংবেদনশীল এবং ছোট নমুনাগুলিতে কাজ করে৷
তাদের সীমাবদ্ধতা হ'ল তারা কেবল তালিকায় যা আছে তা খুঁজে পায়। একই জিনে একটি অস্বাভাবিক বা অভিনব বৈকল্পিক, বা একটি ফিউশন সনাক্ত করা হবে না।
বিস্তৃত NGS প্যানেল
বড় প্যানেলগুলি অনেক জিনের কোডিং অঞ্চলের ক্রমানুসারে এবং প্রতিস্থাপন, সন্নিবেশ এবং মুছে ফেলা, কপি-সংখ্যার পরিবর্তন এবং প্রায়শই ফিউশন এবং জটিল বায়োমার্কার যেমন টিউমার মিউটেশনাল বোঝা এবং মাইক্রোস্যাটেলাইট অস্থিরতা সনাক্ত করতে পারে।
তাদের আরও টিস্যু এবং সময় প্রয়োজন এবং বেশি খরচ হয়, তবে একটি একক পরীক্ষা বর্তমান এবং উদীয়মান লক্ষ্যগুলিকে কভার করতে পারে, অনুক্রমিক পরীক্ষা থেকে টিস্যু নিঃসরণের সম্ভাবনা হ্রাস করে।
নেতিবাচক-ফলাফল সমস্যা
একটি নেতিবাচক হটস্পট ফলাফল সাধারণ এবং বিভ্রান্তিকর হতে পারে। উদাহরণ স্বরূপ, অনেক EGFR exon 20 সন্নিবেশ এবং অস্বাভাবিক EGFR মিউটেশন ক্লাসিক্যাল ভেরিয়েন্টের চারপাশে ডিজাইন করা অ্যাসে দ্বারা মিস করা হয়।
যখন একটি টার্গেটেড থেরাপি এমন একটি মিউটেশন ধরণের জন্য বিদ্যমান থাকে যা অ্যাসে সম্পূর্ণরূপে কভার করে না, তখন একটি নেতিবাচক ফলাফলকে নির্দিষ্ট না করে অসম্পূর্ণ হিসাবে বিবেচনা করা উচিত।
একটি পদ্ধতি নির্বাচন করা
সেটিংসে যেখানে দ্রুত ফলাফল জরুরী সিদ্ধান্তগুলিকে চালিত করে, রিফ্লেক্স ব্রড সিকোয়েন্সিং দ্বারা অনুসরণ করা সবচেয়ে কার্যকর পরিবর্তনের জন্য একটি হটস্পট পরীক্ষা একটি সাধারণ আপস।
নির্দেশিকাগুলি ক্রমবর্ধমানভাবে উন্নত নন-স্মল-সেল ফুসফুসের ক্যান্সারের মতো ক্যান্সারে সামনে বিস্তৃত প্যানেল পরীক্ষার সুপারিশ করে, যেখানে একাধিক বায়োমার্কার প্রত্যেকে অনুমোদিত ওষুধ রয়েছে।
ব্যাখ্যামূলক নোট
একটি প্রতিবেদনে তালিকা করা উচিত যে কোন জিন এবং অঞ্চলগুলি কভার করা হয়েছিল। সেই সুযোগের বিপরীতে একটি নেতিবাচক ফলাফল পড়ুন, একটি কম্বল অনুপস্থিতি হিসাবে নয়।
যদি একটি প্রাথমিক সীমিত পরীক্ষা নেতিবাচক হয় এবং একজন ড্রাইভারের ক্লিনিকাল সন্দেহ বেশি হয়, তাহলে একটি বিস্তৃত পরীক্ষায় বাড়ানো উপযুক্ত।
কী টেকওয়েজ
- ·হটস্পট অ্যাসে দ্রুত এবং সংবেদনশীল কিন্তু শুধুমাত্র তালিকাভুক্ত বৈকল্পিক সনাক্ত করে।
- ·বিস্তৃত NGS প্যানেলগুলি একটি পরীক্ষায় অনেক পরিবর্তনের ধরন এবং বায়োমার্কারগুলিকে কভার করে।
- ·একটি নেতিবাচক হটস্পট ফলাফল এক্সন 20 সন্নিবেশ, অস্বাভাবিক মিউটেশন এবং ফিউশন মিস করতে পারে।
- ·নির্দেশিকা ক্রমবর্ধমানভাবে সামনে বিস্তৃত প্যানেল পরীক্ষার পক্ষে যেখানে একাধিক লক্ষ্য বিদ্যমান।
এই জিনগুলিকে পথের প্রসঙ্গে রাখুন
প্রায়শই জিজ্ঞাসিত প্রশ্ন
এনজিএস প্যানেল বনাম হটস্পট টেস্টিং-এর মূল ধারণা কী: ব্রেডথ বনাম ফোকাস?
আণবিক পরীক্ষার রেঞ্জ ছোট ছোট অ্যাসেস থেকে শুরু করে যা কয়েকশত জিনকে কভার করে বড় পরবর্তী প্রজন্মের সিকোয়েন্সিং প্যানেল পর্যন্ত পরিচিত মিউটেশন অবস্থানের একটি মুষ্টিমেয় পরীক্ষা করে। পছন্দ কি পাওয়া যাবে, কত দ্রুত এবং কিভাবে নেতিবাচক ফলাফল পড়তে হবে তা প্রভাবিত করে।
রেজাল্ট বা মেকানিজমের সাথে কি রাখতে হবে?
বিস্তৃত NGS প্যানেলগুলি একটি পরীক্ষায় অনেকগুলি পরিবর্তনের ধরন এবং বায়োমার্কারকে কভার করে। একটি নেতিবাচক হটস্পট ফলাফল এক্সন 20 সন্নিবেশ, অস্বাভাবিক মিউটেশন এবং ফিউশন মিস করতে পারে। নির্দেশিকাগুলি ক্রমবর্ধমানভাবে বিস্তৃত প্যানেল পরীক্ষার পক্ষে যেখানে একাধিক লক্ষ্য বিদ্যমান রয়েছে।
তথ্যসূত্র
- 1সোমাটিক মিউটেশন প্যানেল: তাদের নাম মুছে ফেলার সময়. ক্যান্সার জেনেটিক্স, 2019. PubMed
- 2পরবর্তী প্রজন্মের সিকোয়েন্সিং-ভিত্তিক অনকোলজি প্যানেলগুলির বৈধতার জন্য নির্দেশিকা. জার্নাল অফ মলিকুলার ডায়াগনস্টিকস, 2017. PubMed
- 3টার্গেটেড টাইরোসিন কিনেস ইনহিবিটর দিয়ে চিকিত্সার জন্য ফুসফুসের ক্যান্সারের রোগীদের নির্বাচনের জন্য আপডেট করা আণবিক পরীক্ষার নির্দেশিকা. প্যাথলজি এবং ল্যাবরেটরি মেডিসিনের আর্কাইভস, 2018. PubMed
- 4ইজিএফআর এক্সন 20 ইনসারশন-মিউটেটেড নন-স্মল-সেল ফুসফুসের ক্যান্সারে অ্যামিভান্টামব: প্রাথমিক CHRYSALIS ফেজ I ফলাফল. ক্লিনিকাল অনকোলজি জার্নাল, 2021. PubMed
পড়া চালিয়ে যান
বায়োমার্কার অ্যাসে বৈধতা: ফলাফলের পিছনে পরীক্ষা কেন গুরুত্বপূর্ণ
3 মিনিট পড়া হয়েছে
সঙ্গী ডায়াগনস্টিকস: নির্দিষ্ট চিকিত্সার সাথে আবদ্ধ পরীক্ষা
3 মিনিট পড়া হয়েছে
জিন ফিউশন টেস্টিং: ফিশ, ইমিউনোহিস্টোকেমিস্ট্রি, ডিএনএ এবং আরএনএ সিকোয়েন্সিং
3 মিনিট পড়া হয়েছে
EGFR Exon 20 সন্নিবেশ: ফুসফুসের ক্যান্সারে একটি স্বতন্ত্র গ্রুপ
3 মিনিট পড়া হয়েছে
সিকোয়েন্সিং ফলাফল নিশ্চিত করা: কখন অর্থোগোনাল পরীক্ষার প্রয়োজন হয়
3 মিনিট পড়া হয়েছে
হোল-এক্সোম বনাম পুরো-জিনোম সিকোয়েন্সিং: প্রতিটি কী কভার করে
3 মিনিট পড়া হয়েছে
আপনার পরবর্তী গবেষণা পদক্ষেপ চয়ন করুন
এই ব্যাখ্যা থেকে একটি জিন প্রোফাইল, একটি পথের মানচিত্র, বা পরবর্তী প্রমাণ আপডেটে সরান।
EGFR আছে 1000+ বর্তমানে ClinicalTrials.gov-এ নিয়োগের পরীক্ষা চলছে। GeneAnalyses ডাইজেস্ট প্রতিদিন নতুন এবং পরিবর্তিতগুলিকে সংক্ষিপ্ত করে৷