ক্যান্সারে আরএনএ বনাম ডিএনএ সিকোয়েন্সিং: পরিপূরক, বিনিময়যোগ্য নয়

কি ডিএনএ সিকোয়েন্সিং ক্যাপচার করে

ডিএনএ সিকোয়েন্সিং পয়েন্ট মিউটেশন, ছোট সন্নিবেশ এবং মুছে ফেলা, কপি-সংখ্যার পরিবর্তন এবং পর্যাপ্ত অন্তর্নিহিত কভারেজ সহ, কিছু কাঠামোগত পুনর্বিন্যাস সনাক্ত করে। এটি স্থিতিশীল জিনোম থেকে কাজ করে, তাই জিন প্রকাশ করা হোক বা না হোক একটি বৈকল্পিক উপস্থিত থাকে।

ডিএনএ আরএনএ-র তুলনায় আর্কাইভাল ফরমালিন-স্থির টিস্যুতে আরও শক্তিশালী, এবং জীবাণু তুলনার জন্য ডিএনএ প্রয়োজন।

আরএনএ সিকোয়েন্সিং কি যোগ করে

আরএনএ সিকোয়েন্সিং ট্রান্সক্রিপ্ট পড়ে, তাই এটি সরাসরি তাদের বিভক্ত জংশনে জিন ফিউশন দেখায়, MET এক্সন 14 স্কিপিং এবং এক্সপ্রেশন লেভেলের মতো স্প্লিসিং পরিবর্তনগুলি দেখায়।

যেহেতু এটি কার্যকরী ফলাফলকে ক্যাপচার করে, তাই RNA নিশ্চিত করতে পারে যে অনিশ্চিত প্রভাবের একটি DNA বৈকল্পিক আসলে স্প্লিসিংকে পরিবর্তন করে, এবং এটি ফিউশন ধরতে পারে যা একটি DNA প্যানেল মিস করে।

যেখানে প্রতিটি ছোট পড়ে

ডিএনএ প্যানেলগুলি বড় ইন্ট্রোনে ব্রেকপয়েন্ট সহ ফিউশন মিস করতে পারে এবং স্প্লিসিং প্রভাব নিশ্চিত করতে পারে না। আরএনএ সিকোয়েন্সিং এমন একটি জিনের মিউটেশন সনাক্ত করতে পারে না যা প্রকাশ করা হয় না, নমুনার মানের প্রতি বেশি সংবেদনশীল, এবং কপি নম্বর এবং টিউমার মিউটেশনাল বোঝার জন্য কম প্রতিষ্ঠিত।

উভয়ই জীবাণু পরীক্ষা প্রতিস্থাপন করে না, যা স্বাভাবিক টিস্যুতে একটি পৃথক ডিএনএ-ভিত্তিক বিশ্লেষণ।

উভয়ই চলছে

অনেক বিস্তৃত প্রোফাইলিং অ্যাসেস এখন একটি ডিএনএ প্যানেলকে একটি আরএনএ ফিউশন প্যানেলের সাথে একত্রিত করে, মিউটেশন এবং কপি নম্বরের জন্য ডিএনএ ব্যবহার করে এবং ফিউশন এবং স্প্লিসিং ইভেন্টের জন্য আরএনএ ব্যবহার করে।

দক্ষতা-পরীক্ষার ডেটা দেখায় যে RNA ফিউশন সনাক্তকরণ কার্যকারিতা পরীক্ষাগারগুলির মধ্যে পরিবর্তিত হয়, তাই একটি সম্মিলিত পরীক্ষার মধ্যেও পদ্ধতি এবং বৈধতা এখনও গুরুত্বপূর্ণ।

ব্যাখ্যামূলক নোট

যদি একটি রিপোর্ট শুধুমাত্র DNA হয় এবং একজন ফিউশন ড্রাইভার ক্লিনিক্যালি প্রত্যাশিত কিন্তু অনুপস্থিত থাকে, তাহলে RNA পরীক্ষা একটি যুক্তিসঙ্গত পরবর্তী পদক্ষেপ।

MET exon 14 স্কিপিং-এর মতো একটি স্প্লিসিং-সম্পর্কিত আবিষ্কার সবচেয়ে আত্মবিশ্বাসের সাথে প্রতিষ্ঠিত হয় যখন RNA প্রমাণ এটিকে সমর্থন করে।

কী টেকওয়েজ

• ·ডিএনএ সিকোয়েন্সিং জিনোম পড়ে: মিউটেশন, কপি নম্বর, কিছু পুনর্বিন্যাস, জীবাণু তুলনা।
• ·আরএনএ সিকোয়েন্সিং ট্রান্সক্রিপ্ট পড়ে: জংশনে ফিউশন, স্প্লিসিং পরিবর্তন, এক্সপ্রেশন।
• ·ডিএনএ গভীর-ইন্ট্রনিক ফিউশন মিস করতে পারে; আরএনএ অপ্রকাশিত জিনের রূপগুলি মিস করতে পারে এবং ভাল আরএনএ প্রয়োজন।
• ·বিস্তৃত পরীক্ষাগুলি ক্রমবর্ধমানভাবে একটি ডিএনএ প্যানেলকে একটি আরএনএ ফিউশন প্যানেলের সাথে যুক্ত করে।