টিউমার বিশুদ্ধতা এবং সিকোয়েন্সিং: নমুনায় কতটা ক্যান্সার রয়েছে

কেন বিশুদ্ধতা একটি সনাক্তকরণ সিলিং সেট করে

যদি একটি নমুনার কোষের মাত্র 20 শতাংশ ক্যান্সার হয়, তবে প্রতিটি ক্যান্সার কোষে উপস্থিত একটি হেটেরোজাইগাস মিউটেশন প্রায় 10 শতাংশ সিকোয়েন্সিং রিডগুলিতে উপস্থিত হবে, কারণ টিউমার ডিএনএ কপির অর্ধেক এটি বহন করে।

যদি অ্যাসের সনাক্তকরণের সীমা প্রায় 5 শতাংশ হয়, তবে সেই মিউটেশন এখনও সনাক্তযোগ্য; বিশুদ্ধতা 10 শতাংশে নেমে গেলে, একই মিউটেশন সনাক্তকরণ থ্রেশহোল্ডের কাছাকাছি বা নীচে পড়ে এবং মিস করা যেতে পারে।

কিভাবে বিশুদ্ধতা অনুমান করা হয়

প্যাথলজিস্টরা একটি দাগযুক্ত স্লাইডে দৃশ্যত বিশুদ্ধতা অনুমান করেন, তবে এটি আনুমানিক এবং পর্যবেক্ষক-নির্ভর। বায়োইনফরম্যাটিক পদ্ধতিগুলি সিকোয়েন্সিং ডেটা থেকেই বিশুদ্ধতা অনুমান করে, অনেকগুলি বৈকল্পিক এবং কপি-সংখ্যার প্যাটার্নগুলির অ্যালিল ভগ্নাংশ ব্যবহার করে।

দুটি অনুমান সর্বদা একমত হয় না, এবং নিম্ন-বিশুদ্ধতার নমুনা উভয় পদ্ধতির দ্বারা নির্ভরযোগ্যভাবে বিশ্লেষণ করা কঠিন।

বিভিন্ন অনুসন্ধানের ফলাফল

নিম্ন বিশুদ্ধতা সবচেয়ে বেশি প্রভাবিত করে সাবক্লোনাল মিউটেশন সনাক্তকরণ, নিম্ন-স্তরের কপি-সংখ্যার পরিবর্তন এবং বিশেষ করে, সমজাতীয় মুছে ফেলা, যা স্বাভাবিক-কোষ সংকেত দ্বারা মুখোশ করা যেতে পারে।

টিউমার মিউটেশনাল ভার এবং মাইক্রোস্যাটেলাইট অস্থিরতার অনুমানগুলিও কম বিশুদ্ধতায় কম নির্ভরযোগ্য কারণ পরিমাপের জন্য টিউমার সংকেত কম থাকে।

নমুনা উন্নত করা

ম্যাক্রোডিসেকশন বা মাইক্রোডিসেকশন, যেখানে প্যাথলজিস্ট মার্ক করে এবং ল্যাবরেটরি স্লাইডের একটি টিউমার-সমৃদ্ধ এলাকা স্ক্র্যাপ করে, কার্যকর বিশুদ্ধতা বাড়ায়। একটি আরো সেলুলার ব্লক নির্বাচন করা, বা একটি নতুন বায়োপসি অনুরোধ, অন্যান্য বিকল্প।

ল্যাবরেটরিগুলি সাধারণত একটি ন্যূনতম বিশুদ্ধতা থ্রেশহোল্ড সেট করে যার নীচে তারা রিপোর্ট করবে না, বা সতর্কতার সাথে রিপোর্ট করবে।

ব্যাখ্যামূলক নোট

একটি রিপোর্টে টিউমারের আনুমানিক বিষয়বস্তু উল্লেখ করা উচিত। কম বিশুদ্ধতার নমুনা থেকে একটি নেতিবাচক ফলাফল সত্য অনুপস্থিতির দুর্বল প্রমাণ।

যদি একটি ক্লিনিক্যালি প্রত্যাশিত মিউটেশন পাওয়া না যায় এবং বিশুদ্ধতা কম থাকে, তাহলে টিউমার নেতিবাচক বলে উপসংহারে আসার আগে একটি ভাল নমুনার পুনরাবৃত্তি পরীক্ষা করা উচিত।

কী টেকওয়েজ

• ·টিউমার বিশুদ্ধতা একটি নমুনা এবং ক্যাপ সনাক্তকরণ সংবেদনশীলতা ক্যান্সার কোষের ভগ্নাংশ।
• ·স্বল্প বিশুদ্ধতা প্রকৃত মিউটেশনকে পরীক্ষা-নিরীক্ষার সীমার নিচে ঠেলে দিতে পারে।
• ·হোমোজাইগাস অপসারণ এবং সাবক্লোনাল পরিবর্তনগুলি সবচেয়ে বেশি প্রভাবিত হয়।
• ·ম্যাক্রোডিসেকশন এবং নমুনা নির্বাচন কার্যকর বিশুদ্ধতা বাড়াতে পারে