Делеции экзона 19 EGFR: что означает биомаркер

Что такое делеция экзона 19

Делеции экзона 19 EGFR удаляют короткий участок кодирующей последовательности из тирозинкиназного домена рецептора. Большинство из них представляют собой делеции внутри рамки, то есть рамка считывания сохраняется, хотя локальная аминокислотная последовательность изменяется. Лаборатории могут сообщать о точных удаленных основаниях или обозначениях белков, а не о сокращении «делеция экзона 19», поэтому полная формулировка варианта имеет значение при проверке результатов.

Изменение изменяет баланс между неактивными и активными конформациями киназы. В подгруппе НМРЛ это может сделать рост опухоли более зависимым от передачи сигналов EGFR и помочь объяснить, почему рассматривается EGFR-направленная терапия. Это не доказывает, что каждая клетка опухоли несет изменения, что это явление передается по наследству или что произойдет ответная реакция.

Как проверяется и интерпретируется результат

Делеции экзона 19 можно обнаружить с помощью таргетного ПЦР-анализа или более широкой панели секвенирования следующего поколения (NGS). Ткани часто предпочтительнее, когда их достаточно, в то время как тестирование ДНК плазмы в циркулирующей опухоли может быть полезно, когда образец ткани недоступен или недостаточен. Отрицательный результат анализа плазмы не всегда исключает изменение, поскольку количество опухолевой ДНК в крови варьируется.

В хорошем отчете указывается тип образца, анализ, обозначение варианта, показатели качества и является ли результат соматическим или зародышевым по объему. Статус сопутствующей диагностики зависит от устройства и показания; его следует проверять в текущем списке устройств FDA, а не делать вывод о наличии результата EGFR на любой коммерческой панели.

Контекст лечения без чрезмерных обещаний

В объявлении FDA, указанном ниже, описано одобрение осимертиниба с химиотерапией на основе платины для местно-распространенного или метастатического НМРЛ с делецией экзона 19 EGFR или заменой экзона 21 L858R, обнаруженной с помощью теста, одобренного FDA. Это заявление ограничивается популяцией, режимом лечения, тестом и датой, указанными на этикетке; это не универсальная рекомендация для каждой стадии рака легких или каждого результата экзона 19.

Резистентность может возникнуть в результате дополнительных изменений EGFR, обхода передачи сигналов, гистологической трансформации или смеси субклонов опухоли. Когда заболевание прогрессирует, следующим полезным шагом обычно является анализ новой клинической картины под руководством врача и обоснованная стратегия повторной биопсии или жидкостной биопсии, где это необходимо. На этой странице объясняются границы биомаркеров и доказательств; он не диагностирует рак и не подбирает лечение.

Ключевые выводы

• ·Делеции экзона 19 EGFR обычно представляют собой изменения киназного домена в рамке считывания; точное обозначение варианта должно быть сохранено.
• ·При тестировании могут использоваться ткани или плазма, но качество образца и дизайн анализа влияют на то, что означает отрицательный результат.
• ·Связанное здесь заявление FDA о лечении относится к местно-распространенному или метастатическому НМРЛ, одобренному тесту и указанному режиму лечения.
• ·Результат биомаркера является свидетельством для клинического обсуждения, а не диагноза, результата наследственного риска или отдельной инструкции по лечению.