Молекулярное остаточное заболевание: использование ctDNA для обнаружения рака, который не может быть обнаружен при визуализации

Концепция

Опухоли выделяют фрагментированную ДНК в кровоток. После лечения, направленного на ликвидацию всех видов рака, положительный результат теста на ДНК циркулирующей опухоли указывает на остаточное заболевание, которое, как показывает большинство исследований, в конечном итоге рецидивирует, часто за несколько месяцев до того, как оно становится видимым при визуализации.

Отрицательный тест является более благоприятным, но не гарантирует излечения, поскольку выделение ДНК может упасть ниже предела обнаружения анализа.

Анализы, основанные на информации об опухолях, и анализы, не связанные с опухолями

Анализы с учетом особенностей опухоли сначала секвенируют удаленную опухоль, создают персонализированную панель, ориентированную на конкретные мутации этого пациента, а затем отслеживают их в крови. Это обеспечивает очень высокую специфичность и чувствительность вплоть до очень низких фракций опухоли.

Анализы, не относящиеся к опухолям, ищут фиксированный набор общих изменений или закономерностей метилирования, не прибегая к опухоли. Они более удобны, но, как правило, менее чувствительны к остаточной болезни низкого уровня.

Проблема чувствительности

Остаточное заболевание может способствовать лишь небольшому количеству мутантных молекул ДНК на миллилитр плазмы. Анализы повышают чувствительность, отслеживая множество мутаций одновременно, используя секвенирование с исправлением ошибок и используя поэтапные варианты, которые встречаются вместе в одном и том же фрагменте ДНК.

Даже в этом случае один отрицательный момент времени имеет ограниченную прогностическую ценность, а серийное тестирование с течением времени является более информативным.

Смешающие факторы

Клональный гематопоэз вносит мутантную ДНК из клонов клеток крови, особенно в таких генах, как DNMT3A, TET2 и TP53, и может вызывать ложноположительные сигналы, если не фильтруется путем секвенирования совпадающих лейкоцитов.

Биологические факторы, такие как тип опухоли, местоположение и скорость пролиферации, сильно влияют на количество выделяемой ДНК, поэтому эффективность анализа не является одинаковой для разных видов рака.

Примечания по интерпретации

Молекулярная резидуальная болезнь является прогностическим фактором во многих ситуациях, но вопрос о том, улучшает ли результаты воздействие на положительный результат, например, путем начала или усиления адъювантной терапии, все еще проверяется в рандомизированных исследованиях.

Результат следует считывать с указанием типа анализа, того, связан ли он с опухолью, и времени относительно лечения.

Ключевые выводы

• ·Положительный результат теста на ктДНК после лечения сигнализирует об остаточном заболевании и предсказывает рецидив в большинстве исследований.
• ·Анализы, основанные на опухолях, более чувствительны, чем тесты, не относящиеся к опухолям, при низком уровне заболевания.
• ·Серийное тестирование является более информативным, чем тестирование в один момент времени.
• ·Улучшает ли действие положительного результата выживаемость, все еще находится на стадии судебного расследования.