Все функции гена
Восстановление ДНКРуководство по краеугольному камню

Гены реакции на повреждение ДНК

Каждая человеческая клетка подвергается примерно 70 000 событиям повреждения ДНК в день, начиная от окисления оснований и ошибок репликации и заканчивая двухцепочечными разрывами (DSB), индуцированными ионизирующим излучением или коллапсом репликационной вилки. Реакция на повреждение ДНК (DDR) представляет собой скоординированную сигнальную сеть, которая обнаруживает эти повреждения, останавливает клеточный цикл, чтобы обеспечить восстановление, и — если повреждение непоправимо — инициирует апоптоз или необратимое старение. Архитектура DDR иерархична: сенсорные киназы (ATM, ATR) фосфорилируют сотни субстратов, трансдукторные киназы (CHK1, CHK2) усиливают и распределяют сигнал, а эффекторные белки выполняют клеточный ответ.

Быстрый ответ

Когда происходит DSB, комплекс MRN (MRE11-RAD50-NBS1) обнаруживает разорванные концы ДНК в течение нескольких секунд и рекрутирует киназу ATM. Активированный ATM фосфорилирует гистон H2AX (γH2AX) по мегабазным доменам, фланкирующим разрыв, создавая каркас для дальнейшего рекрутирования белка DDR. Одновременно ATM фосфорилирует CHK2 (Thr68), p53 (Ser15) и BRCA1 (Ser1387/1423), координируя арест G1/S (через p53 → p21), арест внутриS-фазы (через деградацию CDC25A) и арест G2/M (через ингибирование CHK2 → CDC25C), одновременно способствуя репарации гомологичной рекомбинации через BRCA1.

Обзор механизма

Когда происходит DSB, комплекс MRN (MRE11-RAD50-NBS1) обнаруживает разорванные концы ДНК в течение нескольких секунд и рекрутирует киназу ATM. Активированный ATM фосфорилирует гистон H2AX (γH2AX) по мегабазным доменам, фланкирующим разрыв, создавая каркас для дальнейшего рекрутирования белка DDR. Одновременно ATM фосфорилирует CHK2 (Thr68), p53 (Ser15) и BRCA1 (Ser1387/1423), координируя арест G1/S (через p53 → p21), арест внутриS-фазы (через деградацию CDC25A) и арест G2/M (через ингибирование CHK2 → CDC25C), одновременно способствуя репарации гомологичной рекомбинации через BRCA1.

Путь реакции на повреждение ДНК

Двухцепочечный разрыв ДНККомплекс MRNMRE11 · RAD50 · NBS1АТМ-киназаCHK2CDC25A/CдеградацияАрест клеточного циклаTP53стр.21 / ПУМААпоптоз/G1BRCA1PALB2 · RAD51Ремонт кадровMDM2
киназа/сигнализацияонкогенсупрессор опухолисотовый выходзапрещает

Пошаговый путь

1
Обнаружение разрыва с помощью комплекса MRN

Комплекс MRN (нуклеаза MRE11, структурная АТФаза RAD50, адаптер NBS1) распознает концы двухцепочечного разрыва ДНК в течение нескольких секунд после образования. NBS1 напрямую контактирует и рекрутирует киназу ATM в место повреждения через свой C-концевой мотив связывания ATM.

2
Активация ATM и распространение γH2AX

MRN-стимулированный ATM подвергается аутофосфорилированию по Ser1981, высвобождая активные мономеры, которые распространяются вдоль хроматина. ATM фосфорилирует гистон H2AX по Ser139 (создавая γH2AX) в доменах мегабаз, усиливая сигнал повреждения и рекрутируя MDC1, RNF8 и RNF168.

3
Активация CHK2 и применение контрольных точек

ATM фосфорилирует CHK2 по Thr68, обеспечивая димеризацию CHK2 и транс-аутофосфорилирование. Активный CHK2 фосфорилирует p53 (Ser20), усиливая стабильность p53. CHK2 также фосфорилирует CDC25A, направляя его на деградацию и вызывая арест внутри S-фазы.

4
p53 Стабилизация и остановка G1

Фосфорилирование p53 ATM (Ser15) и CHK2 (Ser20) нарушает его взаимодействие с MDM2. Стабилизированный р53 транскрибирует CDKN1A (p21), который ингибирует CDK2/циклин E, останавливая переход из фазы G1 в фазу S и обеспечивая окно для репарации ДНК.

5
BRCA1-опосредованная гомологичная рекомбинация

ATM-фосфорилированный BRCA1 рекрутируется в DSB через убиквитиновый путь RNF8/RNF168/RAP80. BRCA1 способствует резекции концов ДНК (генерируя 3'-выступы оцДНК) и связывается с PALB2-BRCA2-RAD51, катализируя направленную на матрицу инвазию цепи для высокоточного восстановления.

6
Завершение репарации или апоптоз

Если репарация успешна, фосфатазы PP2A дефосфорилируют γH2AX и CHK2, высвобождая контрольные точки клеточного цикла и позволяя возобновить деление. Устойчивое или непоправимое повреждение поддерживает активацию р53 за пределами апоптотического порога, запуская BAX/PUMA-опосредованный митохондриальный апоптоз.

Актуальность заболевания

Зародышевые мутации в ATM (атаксия-телеангиэктазия), BRCA1/BRCA2 (наследственный рак молочной железы/яичников), CHEK2 (умеренный риск рака молочной железы) и TP53 (синдром Ли-Фраумени) вызывают отдельные синдромы наследственного рака, определяемые конкретным этапом пути DDR, который терпит неудачу. Соматические мутации гена DDR при спорадическом раке накапливаются после первоначальной потери опухолевого супрессора — в частности, мутации TP53 (>50% всех видов рака), которая устраняет апоптотическое обеспечение безопасности и позволяет клеткам с непоправимыми повреждениями ДНК выживать и пролиферировать.

Терапевтические последствия

Дефекты репарации ДНК могут создавать уязвимости для лечения, но биомаркер нельзя свести к названию гена. Доказательства применения ингибитора PARP зависят от типа опухоли, зародышевого или соматического статуса, контекста гомологичной рекомбинации, линии терапии и режима. Потеря ATM изучается с использованием ATR и других ингибиторов контрольных точек, но она не является взаимозаменяемой с потерей BRCA1/2. Статус MSI-высокий или дефицитный по репарации несоответствия имеет показания для иммунотерапии. Чувствительность и резистентность к платине также варьируются в зависимости от заболевания и сопутствующих изменений.

Общие вопросы

В чем разница между ATM и ATR в реакции на повреждение ДНК?

АТМ в первую очередь реагирует на двухцепочечные разрывы ДНК (DSB) и активируется комплексом MRN. ATR реагирует на одноцепочечную ДНК (оцДНК), возникающую в результате остановки репликационной вилки, промежуточных репараций вырезания оснований или репарации вырезания нуклеотидов. Сигналы банкомата через CHK2; ATR сигнализирует через CHK1. Оба сходятся на общих эффекторах, включая фосфатазы p53 и CDC25.

Что такое синтетическая летальность в контексте репарации ДНК?

Синтетическая летальность возникает, когда одновременная потеря двух генов приводит к летальному исходу, тогда как потеря любого из них по отдельности позволяет выжить. Раковые клетки с дефицитом BRCA1/2 не могут осуществлять гомологичную рекомбинацию; когда PARP (необходимый для восстановления SSB) также ингибируется, невосстановленные SSB разрушают репликационные вилки в DSB, которые не могут быть восстановлены, избирательно убивая опухолевые клетки, сохраняя при этом нормальные клетки, способные к HR.

Что такое BRCAness?

BRCAness относится к геномному фенотипу в опухолях без мутаций BRCA1/2, которые, тем не менее, демонстрируют дефицит HR, характеризующийся высокой геномной потерей гетерозиготности, теломерным аллельным дисбалансом и крупномасштабными переходами состояний. Наличие BRCA от других мутаций гена DDR (ATM, PALB2, RAD51C) также предсказывает чувствительность к ингибитору PARP.

Исследуйте ключевые гены

Статьи по теме

Объяснение основных генов-супрессоров опухолей

Поймите, как гены-супрессоры опухолей, включая TP53, BRCA1, PTEN и RB1, действуют как тормоза генома, и что происходит, когда они теряются при раке.

BRCA1: гомологичная рекомбинация, наследственный риск и HRD

Понять BRCA1 в гомологичной рекомбинации, чем различаются данные зародышевой линии и опухоли, что HRD может и не может установить, и почему доказательства PARP зависят от контекста.

АТМ-киназа и реакция на повреждение ДНК

Как ATM координирует реакцию на повреждение ДНК, что означают изменения зародышевой линии и опухоли, и почему потеря ATM не является взаимозаменяемой с дефицитом BRCA.

Генные мутации, вызывающие заболевания

Узнайте, как различные типы генных мутаций — точечные мутации, делеции, амплификации и слияния — вызывают рак и наследственные заболевания, на реальных примерах из TP53, KRAS и BRCA1.

Изучите другие функции генов

Сети-супрессоры опухолей

Гены-супрессоры опухолей кодируют белки, которые активно сдерживают пролиферацию клеток, способствуют восстановлению ДНК или устраняют даму.

TP53BRCA1PTEN

Репарация гомологичной рекомбинации

Гомологичная рекомбинация (HR) восстанавливает двухцепочечные разрывы ДНК преимущественно в S/G2, когда сестринская хроматида доступна

BRCA1ATMPTEN

Гены регуляции клеточного цикла

Деление клеток регулируется биохимическим осциллятором, построенным из циклин-зависимых киназ (CDK) и их циклиновой регуляции.

CDK4RB1CDKN2A

Регуляторы апоптоза

Апоптоз — запрограммированная гибель клеток — представляет собой окончательный механизм подавления опухоли, уничтожающий клетки с необратимыми повреждениями.

BCL2TP53AKT1

Сигнальный путь EGFR-KRAS-BRAF-MEK-ERK при раке

Сигнальный путь EGFR преобразует внеклеточное связывание EGF во внутриклеточные сигналы пролиферации и выживания посредством

EGFRKRASBRAF

Сигнальный путь PI3K/AKT/mTOR

Путь PI3K/AKT/mTOR объединяет сигналы фактора роста, питательных веществ и энергии для регуляции выживания, роста и метаболизма клеток.

PIK3CAPTENAKT1
Просмотр всех функций гена

Ссылки

  1. 1Чичча А., Элледж С.Дж. (2010). Реакция на повреждение ДНК: как сделать игру с ножами безопасной. Мол Клетка. PubMed 21111241
  2. 2Джексон С.П., Бартек Дж. (2009). Реакция на повреждение ДНК в биологии человека и заболеваниях. Природа. PubMed 19855398
  3. 3Лорд Си Джей, Эшворт А. (2017). Ингибиторы PARP: синтетическая летальность в клинике. Наука. PubMed 28302823
  4. 4Харпер Дж.В., Элледж С.Дж. (2007). Реакция на повреждение ДНК: десять лет спустя. Мол Клетка. PubMed 17344418