Все статьи
Генетика рака· 3 минуты чтения

DNMT3A и TET2 в клональном кроветворении

По мере старения людей отдельные гемопоэтические стволовые клетки могут приобретать мутации, которые дают им преимущество в росте, создавая обнаруживаемый клон клеток крови без какого-либо рака крови. Два наиболее часто задействованных гена, DNMT3A и TET2, являются противоположными регуляторами метилирования ДНК. Это состояние называется клональным кроветворением неопределенного потенциала, или ЧИП.

Быстрый ответ

По мере старения людей отдельные гемопоэтические стволовые клетки могут приобретать мутации, которые дают им преимущество в росте, создавая обнаруживаемый клон клеток крови без какого-либо рака крови. Два наиболее часто задействованных гена, DNMT3A и TET2, являются противоположными регуляторами метилирования ДНК. Это состояние называется клональным кроветворением неопределенного потенциала, или ЧИП.

DNMT3A и TET2 в клональном кроветворении: механизм и карта интерпретацииТри связанных этапа суммируют механизм статьи, измеряемый эффект и границы интерпретации.TP53 · Банкомат1Два противоположных метилирования…Механизм2Что такое ЧИП и чем он не являетсяНаблюдаемое последствие3Нераковые ассоциацииИнтерпретировать в контекстеДоказательства гена или пути → измеренный фенотип → заключение, основанное на анализе
Карта механизма: основные биологические стадии в статье отделены от окончательной интерпретации, поэтому взаимосвязь путей не может быть ошибочно принята за клиническое заключение.

Часть тематического кластера

Эпигенетика рака и регуляторы хроматина

Открыть полное руководство из 15 статей.

Два противоположных регулятора метилирования

DNMT3A добавляет метильные группы к цитозину для установления закономерностей метилирования ДНК. ТЕТ2 начинает процесс их удаления путем окисления 5-метилцитозина. Мутации потери функции в любом гене сдвигают баланс метилирования ДНК в стволовых клетках крови и изменяют гены, которые они экспрессируют.

В результате получается стволовая клетка, которая самообновляется немного более эффективно, чем ее соседи. Спустя годы это скромное преимущество позволяет его потомкам составлять измеримую долю циркулирующих клеток крови.

Что такое ЧИП и чем он не является

CHIP определяется как клон, вызванный мутацией, связанной с лейкемией, с фракцией вариантного аллеля, составляющей по меньшей мере 2 процента, у человека с нормальными показателями крови и без рака крови. Около 80 процентов CHIP включают DNMT3A, TET2 или ASXL1.

ЧИП часто встречается с возрастом и присутствует примерно у 10 или более процентов людей старше 70 лет. Он несет в себе небольшой риск прогрессирования в рак крови, порядка полупроцента-одного процента в год, поэтому у большинства людей с ЧИП он никогда не развивается.

Нераковые ассоциации

CHIP связан примерно с двукратным увеличением сердечно-сосудистого риска независимо от традиционных факторов риска, который, как полагают, действует посредством провоспалительного состояния, вызываемого мутантными иммунными клетками. Сообщалось также о связи с повреждением почек, а также с последствиями сердечной недостаточности и аортального стеноза.

Это ассоциации на популяционном уровне, полученные из эпидемиологических исследований. Не существует общепринятого лечения самого CHIP, и он часто является случайной находкой при исследовании опухоли или секвенировании зародышевой линии.

Почему это важно для интерпретации теста

Поскольку кровь является обычным источником зародышевой ДНК, мутация CHIP может появиться при тесте на наследственный рак и быть ошибочно принята за зародышевую линию или появиться в циркулирующей опухолевой ДНК и быть ошибочно отнесена к опухоли. Ключом к разгадке являются низкая фракция аллелей вариантов и ген, типичный для CHIP.

Парное тестирование некровяной ткани может устранить неопределенность, когда это имеет значение.

ЧИП и лечение рака

CHIP пересекается с онкологией двумя практическими способами. Цитотоксическая химиотерапия и лучевая терапия могут дать конкурентное преимущество мутантным клонам CHIP с мутациями TP53 или PPM1D, а связанные с терапией миелоидные новообразования иногда восходят к клону, который был обнаружен до лечения. Именно по этой причине CHIP привлекает внимание при планировании лечения пациентов, которым могут потребоваться годы наблюдения.

Для человека, у которого случайно обнаружен CHIP, обычным ответом является полный анализ крови и клиническое обследование, а не какое-либо конкретное вмешательство, при этом направление к гематологу зарезервировано для признаков повышенного риска, таких как большой клон, множественные мутации или необъяснимые низкие показатели крови.

Исследуйте:TP53

Ключевые выводы

  • ·Мутации DNMT3A и TET2 являются наиболее распространенными факторами возрастного клонального кроветворения.
  • ·ЧИП означает клон клеток крови без рака крови, с низкой годовой скоростью прогрессирования.
  • ·Мутации CHIP могут мешать тестированию ДНК зародышевой линии и циркулирующей опухоли и часто являются случайными.

Поместите эти гены в контекст пути.

Часто задаваемые вопросы

Означает ли CHIP, что у меня лейкемия или я заболею лейкемией?

Нет. CHIP представляет собой клон клеток крови без какого-либо рака крови, и прогрессирование злокачественного новообразования крови происходит со скоростью примерно от полпроцента до одного процента в год, поэтому у большинства людей с CHIP он никогда не развивается.

Почему в моем тесте на наследственный рак появляется мутация DNMT3A или TET2?

Кровь является обычным источником зародышевой ДНК, поэтому приобретенную мутацию в клоне клеток крови можно принять и ошибочно принять за наследственную. Низкая вариантная аллельная фракция и CHIP-типичный ген являются ключом к разгадке, и тестирование некровяной ткани позволяет решить эту проблему.

Имеет ли CHIP отношение к чему-либо, кроме рака крови?

Эпидемиологические исследования связывают это с примерно двукратным увеличением сердечно-сосудистого риска и с другими последствиями, которые, как полагают, действуют через воспаление. Устоявшегося лечения самого ЧИПа не существует.

Ссылки

  1. 1Клональный гемопоэз неопределенного потенциала (CHIP): связь соматических мутаций, гемопоэза, хронического воспаления и сердечно-сосудистых заболеваний.. J Mol Cell Cardiol, 2021. PubMed
  2. 2Клональный гемопоэз неопределенного потенциала связан с острым повреждением почек. Нат Мед, 2024. PubMed
  3. 3Признаки рака: новые измерения. Рак Дисков, 2022. PubMed

Продолжить чтение

Выберите следующий шаг исследования

Перейдите от этого объяснения к профилю генов, карте путей или следующему обновлению данных.

TP53 имеет 100+ клинические испытания, которые в настоящее время набираются на ClinicalTrials.gov. Дайджест GeneAnalyses суммирует новые и измененные каждый день.