Cómo leer un informe de prueba genética de cáncer hereditario

Lo que se probó

El informe debe enumerar los genes analizados y el tipo de análisis: secuenciación completa, análisis de gran reordenamiento (deleción y duplicación) o pruebas dirigidas a variantes conocidas específicas. No se evaluó un gen que no estaba en el panel.

También debe indicar el tipo de muestra, generalmente sangre o saliva, confirmando que se trata de una prueba de línea germinal (constitucional) en lugar de una prueba de tumor.

La clasificación de cinco niveles

Las variantes se clasifican como patógenas, probablemente patógenas, de significado incierto, probablemente benignas o benignas. Sólo las variantes patógenas y probablemente patógenas se consideran clínicamente procesables.

Una variante de significado incierto significa que las pruebas son actualmente insuficientes. No es un resultado positivo parcial y por sí solo no debería provocar cambios en las pruebas de detección o la cirugía.

Positivo, Negativo y No Informativo

Un resultado positivo identifica una variante patógena o probablemente patógena. Un verdadero negativo se aplica cuando se analizó una variante familiar específica y no se encontró; el riesgo de la persona generalmente regresa al nivel de la población.

Un negativo no informativo, en el que no se encuentra ninguna variante pero no se conoce ninguna variante familiar, no excluye el riesgo hereditario, especialmente con una fuerte historia familiar.

Significado específico del gen

Las implicaciones de una variante patogénica dependen del gen. Los genes de alto riesgo como BRCA1, BRCA2 y los genes de reparación de discordancias han establecido vías de vigilancia y reducción de riesgos. Los genes de riesgo moderado, como ATM y CHEK2, generalmente significan una detección mejorada con riesgo ajustado por los antecedentes familiares.

Las recomendaciones de gestión del informe son generales; Las decisiones individuales se toman con un equipo de genética clínica u oncología.

Notas de interpretación

Las clasificaciones pueden cambiar con el tiempo. Los laboratorios pueden reclasificar una variante a medida que se acumula nueva evidencia y reemitir el informe, por lo que la fecha del informe es importante.

Los hallazgos secundarios o incidentales en genes no relacionados con la indicación de la prueba se manejan de acuerdo con la política y el consentimiento declarados del laboratorio.

Conclusiones clave

• ·Compruebe qué genes y qué tipos de análisis se realizaron realmente.
• ·Sólo las variantes patógenas y probablemente patógenas son procesables; una VUS no lo es.
• ·Un verdadero negativo requiere una variante familiar conocida contra la cual realizar la prueba.
• ·Las implicaciones del manejo dependen del gen específico y se finalizan con un especialista.