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Gènes de réponse aux dommages de l'ADN

Chaque cellule humaine subit environ 70 000 dommages à l'ADN par jour, allant des oxydations de bases et des erreurs de réplication aux cassures double brin (DSB) induites par les rayonnements ionisants ou l'effondrement des fourches de réplication. La réponse aux dommages de l'ADN (DDR) est un réseau de signalisation coordonné qui détecte ces lésions, arrête le cycle cellulaire pour permettre la réparation et, si les dommages sont irréparables, déclenche l'apoptose ou la sénescence permanente. L'architecture du DDR est hiérarchique : les kinases capteurs (ATM, ATR) phosphorylent des centaines de substrats, les kinases transducteurs (CHK1, CHK2) amplifient et distribuent le signal, et les protéines effectrices exécutent la réponse cellulaire.

Réponse rapide

Lorsqu'un DSB se produit, le complexe MRN (MRE11 – RAD50 – NBS1) détecte les extrémités d'ADN cassées en quelques secondes et recrute la kinase ATM. L'ATM activé phosphoryle l'histone H2AX (γH2AX) dans les domaines de mégabase entourant la cassure, créant ainsi un échafaudage pour un recrutement ultérieur de protéines DDR. Simultanément, ATM phosphoryle CHK2 (Thr68), p53 (Ser15) et BRCA1 (Ser1387/1423), coordonnant l'arrêt G1/S (via p53 → p21), l'arrêt de phase intra-S (via la dégradation de CDC25A) et l'arrêt G2/M (via l'inhibition de CHK2 → CDC25C), tout en favorisant la réparation par recombinaison homologue via BRCA1.

Présentation du mécanisme

Lorsqu'un DSB se produit, le complexe MRN (MRE11 – RAD50 – NBS1) détecte les extrémités d'ADN cassées en quelques secondes et recrute la kinase ATM. L'ATM activé phosphoryle l'histone H2AX (γH2AX) dans les domaines de mégabase entourant la cassure, créant ainsi un échafaudage pour un recrutement ultérieur de protéines DDR. Simultanément, ATM phosphoryle CHK2 (Thr68), p53 (Ser15) et BRCA1 (Ser1387/1423), coordonnant l'arrêt G1/S (via p53 → p21), l'arrêt de phase intra-S (via la dégradation de CDC25A) et l'arrêt G2/M (via l'inhibition de CHK2 → CDC25C), tout en favorisant la réparation par recombinaison homologue via BRCA1.

Voie de réponse aux dommages causés à l'ADN

Rupture double brin d'ADNComplexe MRNMRE11 · RAD50 · NBS1ATM kinaseCHK2CDC25A/CdégradationArrêt du cycle cellulaireTP53p21 / PUMAApoptose / G1BRCA1PALB2 · RAD51Réparation RHMDM2
kinase / signalisationoncogènesuppresseur de tumeursortie cellulaireinhibe

Parcours étape par étape

1
Détection de rupture par Complexe MRN

Le complexe MRN (nucléase MRE11, ATPase structurale RAD50, adaptateur NBS1) reconnaît les extrémités cassées double brin de l'ADN quelques secondes après sa formation. NBS1 contacte et recrute directement la kinase ATM sur le site du dommage via son motif de liaison ATM C-terminal.

2
Activation ATM et propagation γH2AX

L'ATM stimulé par MRN subit une autophosphorylation à Ser1981, libérant des monomères actifs qui se propagent le long de la chromatine. ATM phosphoryle l'histone H2AX au niveau de Ser139 (créant γH2AX) dans les domaines de mégabase, amplifiant le signal de dommage et recrutant MDC1, RNF8 et RNF168.

3
Activation CHK2 et application des points de contrôle

ATM phosphoryle CHK2 à Thr68, permettant la dimérisation et la trans-autophosphorylation de CHK2. La CHK2 active phosphoryle la p53 (Ser20), renforçant ainsi la stabilité de la p53. CHK2 phosphoryle également CDC25A, le ciblant pour sa dégradation et imposant un arrêt de phase intra-S.

4
p53 Stabilisation et arrestation G1

Les phosphorylations ATM (Ser15) et CHK2 (Ser20) de p53 perturbent son interaction avec MDM2. La p53 stabilisée transcrit CDKN1A (p21), qui inhibe CDK2/cycline E, stoppant la progression de la phase G1 vers la phase S et ouvrant une fenêtre pour la réparation de l'ADN.

5
Recombinaison homologue médiée par BRCA1

BRCA1 phosphorylé par ATM est recruté dans les DSB via la voie de l'ubiquitine RNF8/RNF168/RAP80. BRCA1 favorise la résection des extrémités de l'ADN (générant des surplombs d'ADNsb en 3 ') et des ponts vers PALB2 – BRCA2 – RAD51, catalysant l'invasion des brins dirigée par la matrice pour une réparation haute fidélité.

6
Achèvement de la réparation ou apoptose

Si la réparation réussit, les phosphatases PP2A déphosphorylent γH2AX et CHK2, libérant les points de contrôle du cycle cellulaire et permettant la reprise de la division. Des dommages soutenus ou irréparables maintiennent l'activation de p53 au-delà du seuil apoptotique, déclenchant l'apoptose mitochondriale médiée par BAX/PUMA.

Pertinence pour la maladie

Les mutations germinales dans ATM (ataxie-télangiectasie), BRCA1/BRCA2 (cancer héréditaire du sein/de l'ovaire), CHEK2 (risque modéré de cancer du sein) et TP53 (syndrome de Li-Fraumeni) provoquent des syndromes de cancer héréditaires distincts définis par l'étape spécifique de la voie DDR qui échoue. Les mutations somatiques du gène DDR dans les cancers sporadiques s’accumulent après la perte initiale du suppresseur de tumeur – en particulier la mutation TP53 (> 50 % de tous les cancers), qui élimine le filet de sécurité apoptotique et permet aux cellules présentant des dommages irréparables à l’ADN de survivre et de proliférer.

Implications thérapeutiques

Les défauts de réparation de l'ADN peuvent créer des vulnérabilités au traitement, mais le biomarqueur ne peut pas être réduit à un nom de gène. Les preuves des inhibiteurs de PARP dépendent du type de tumeur, de l'état germinal ou somatique, du contexte de recombinaison homologue, de la ligne de traitement et du régime. La perte ATM est étudiée avec l'ATR et d'autres inhibiteurs de point de contrôle, mais n'est pas interchangeable avec la perte BRCA1/2. Le statut MSI élevé ou déficient en réparation des mésappariements a des preuves d'immunothérapie spécifiques à l'indication. La sensibilité et la résistance du platine varient également en fonction de la maladie et des co-altérations.

Questions courantes

Quelle est la différence entre ATM et ATR dans la réponse aux dommages de l'ADN ?

L'ATM répond principalement aux cassures double brin (DSB) de l'ADN et est activé par le complexe MRN. L'ATR répond à l'ADN simple brin (ADNsb) résultant du blocage de la fourche de réplication, des intermédiaires de réparation par excision de base ou de la réparation par excision de nucléotides. Signaux ATM via CHK2 ; ATR signale via CHK1. Les deux convergent vers des effecteurs communs, notamment les phosphatases p53 et CDC25.

Qu'est-ce que la létalité synthétique dans le contexte de la réparation de l'ADN ?

La létalité synthétique se produit lorsque la perte simultanée de deux gènes est mortelle alors que la perte de l'un ou l'autre seul permet de survivre. Les cellules cancéreuses déficientes en BRCA1/2 ne peuvent pas effectuer de recombinaison homologue ; lorsque la PARP (nécessaire à la réparation des SSB) est également inhibée, les SSB non réparés effondrent les fourches de réplication en DSB qui ne peuvent pas être réparés, tuant sélectivement les cellules tumorales tout en épargnant les cellules normales compétentes en RH.

Qu'est-ce que le BRCAness ?

BRCAness fait référence à un phénotype génomique dans des tumeurs sans mutations BRCA1/2 qui présentent néanmoins un déficit en HR, caractérisé par une perte génomique élevée d'hétérozygotie, un déséquilibre allélique télomérique et des transitions d'état à grande échelle. Le BRCAness provenant d'autres mutations du gène DDR (ATM, PALB2, RAD51C) prédit également la sensibilité aux inhibiteurs de PARP.

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Références

  1. 1Ciccia A, Elledge SJ (2010). La réponse aux dommages à l'ADN : rendre le jeu avec des couteaux sûr. Cellule Mol. PubMed 21111241
  2. 2Jackson SP, Bartek J. (2009). La réponse aux dommages à l'ADN dans la biologie humaine et les maladies. Nature. PubMed 19855398
  3. 3Lord CJ, Ashworth A. (2017). Inhibiteurs de PARP : létalité synthétique en clinique. Sciences. PubMed 28302823
  4. 4Harper JW, Elledge SJ (2007). La réponse aux dommages à l'ADN : dix ans après. Cellule Mol. PubMed 17344418