Tests par panel multigénique pour le cancer héréditaire : ce qu'ils ajoutent

Des gènes uniques aux panels

Les coûts de séquençage ont suffisamment baissé pour que tester 20 à 80 gènes ou plus ne coûte guère plus que d'en tester un ou deux. Les panels peuvent identifier une cause héréditaire qu'un test ciblé ne manquerait pas, par exemple en trouvant une variante de réparation des mésappariements chez une personne testée pour les gènes du cancer du sein.

Les études portant sur des patients répondant aux critères d'un syndrome révèlent fréquemment des variantes pathogènes dans des gènes inattendus, ce qui constitue le principal argument en faveur d'une approche plus large.

Le compromis entre la variante de signification incertaine

Chaque gène supplémentaire analysé augmente les chances de trouver une variante qui ne peut pas encore être classée comme pathogène ou bénigne. Des panels plus grands renvoient donc davantage de variantes de signification incertaine, ce qui peut provoquer de l'anxiété et, en cas de mauvaise utilisation, une gestion inappropriée.

Une variante de signification incertaine ne devrait pas modifier la prise en charge médicale. Seuls les variants classés comme pathogènes ou probablement pathogènes sont traités.

Le contenu des gènes n'est pas standardisé

Les panels diffèrent selon les laboratoires. Certains incluent uniquement des gènes présentant un risque établi et exploitable ; d'autres ajoutent des gènes dont les preuves sont plus faibles ou incertaines. Tester un gène pour lequel il n’existe aucune directive de gestion convenue peut produire un résultat que personne ne sait comment utiliser.

Les gènes analysés et le cadre de classification du laboratoire font partie de l'interprétation de tout rapport de panel.

Gènes à risque élevé, modéré et incertain

Les panels mélangent des gènes présentant des niveaux de risque très différents. BRCA1, BRCA2, TP53 et les gènes de réparation des mésappariements comportent des risques élevés et bien définis. ATM, CHEK2, BRIP1 et autres comportent des risques modérés fortement modifiés par les antécédents familiaux. Certains gènes présents sur les panels présentent des risques qui sont encore en cours de définition.

Un variant pathogène dans un gène à risque modéré n'entraîne pas les mêmes implications qu'un variant dans un gène à haut risque, et la prise en charge diffère en conséquence.

Notes d'interprétation

Les résultats du panel sont mieux rendus avec un conseil génétique qui place le gène et la variante spécifiques dans le contexte de l'histoire de la personne et des preuves actuelles.

Un panel négatif n'exclut pas le risque héréditaire, car tous les gènes de prédisposition ne sont pas connus et certains types variants sont difficiles à détecter.

Points clés à retenir

• ·Les panels détectent les causes héréditaires qui manquent aux tests monogéniques.
• ·Ils renvoient également davantage de variantes de signification incertaine, qui ne devraient pas changer la direction.
• ·Le contenu génétique varie d'un laboratoire à l'autre et affecte l'utilisabilité d'un résultat.
• ·Les gènes à risque élevé, modéré et incertain sur le même panel ne sont pas équivalents.