Fenotip Metilator Pulau CpG (CIMP)
Beberapa tumor menunjukkan metilasi simultan dari banyak promotor pulau CpG, jauh lebih banyak daripada yang diharapkan secara kebetulan. Fenotip metilator pulau CpG, atau CIMP, pertama kali dideskripsikan pada kanker kolorektal dan sejak itu telah dilaporkan pada glioma, lambung, dan kanker lainnya, meskipun definisinya bervariasi antar penelitian.
Jawaban Cepat
Beberapa tumor menunjukkan metilasi simultan dari banyak promotor pulau CpG, jauh lebih banyak daripada yang diharapkan secara kebetulan. Fenotip metilator pulau CpG, atau CIMP, pertama kali dideskripsikan pada kanker kolorektal dan sejak itu telah dilaporkan pada glioma, lambung, dan kanker lainnya, meskipun definisinya bervariasi antar penelitian.
Bagian dari cluster topik
Epigenetika Kanker dan Regulator Kromatin
Buka panduan lengkap 15 artikelProgram Metilasi Terkoordinasi
CIMP diidentifikasi dengan menguji panel lokus penanda; tumor yang sebagian besarnya termetilasi disebut CIMP-high. Fenotip menyiratkan bahwa ada sesuatu yang secara sistematis mendorong metilasi promotor, bukan serangkaian peristiwa independen.
Pada kanker kolorektal, tumor setinggi CIMP sangat terkait dengan mutasi BRAF V600E dan muncul terutama dari lesi bergerigi sesil dibandingkan adenoma konvensional.
Kaitannya dengan MLH1 dan Ketidakstabilan Mikrosatelit
Konsekuensi utama CIMP pada kanker kolorektal adalah metilasi promotor MLH1, yang membungkam gen perbaikan ketidakcocokan ini dan menghasilkan ketidakstabilan mikrosatelit sporadis. Inilah mekanisme di balik sebagian besar kanker kolorektal tinggi MSI yang bukan disebabkan oleh sindrom Lynch.
Jadi profil tumor yang mengandung CIMP, mutan BRAF, dan termetilasi MLH1 menentang penyebab yang diturunkan, sedangkan MSI tanpa ciri-ciri ini meningkatkan kemungkinan sindrom Lynch.
Peringatan
Tidak ada satu panel penanda atau ambang batas yang disepakati untuk CIMP, sehingga prevalensi dan hubungan prognostik berbeda antara penelitian dan jenis kanker. CIMP pada glioma (terkait dengan mutasi IDH) secara biologis berbeda dari CIMP kolorektal.
Status CIMP terutama digunakan dalam penelitian dan dalam menafsirkan asal mula ketidakstabilan mikrosatelit, bukan sebagai pemilih perlakuan langsung.
Bagaimana CIMP Menginformasikan Interpretasi
Manfaat praktis dari penilaian CIMP pada kanker kolorektal adalah dalam menafsirkan ketidakstabilan mikrosatelit. Pola termetilasi MLH1 dengan tingkat CIMP yang tinggi, BRAF V600E, menunjukkan penyebab sporadis dan menentang sindrom Lynch, sehingga tidak memerlukan pengujian germline yang tidak perlu, sedangkan ketidakstabilan mikrosatelit tanpa fitur-fitur tersebut menjadikan penyebab bawaan tetap menjadi pertimbangan.
CIMP sendiri tidak digunakan untuk memilih suatu obat. Kanker kolorektal yang bermutasi BRAF, yang sangat mirip dengan penyakit tingkat CIMP, diobati dengan penghambat BRAF ditambah antibodi anti-EGFR, namun keputusan tersebut mengikuti hasil BRAF dan bukan berdasarkan fenotip metilator.
Poin Penting
- ·CIMP menjelaskan hipermetilasi terkoordinasi dari banyak pulau CpG promotor pada tumor.
- ·CIMP kolorektal terkait dengan BRAF V600E dan pembungkaman MLH1 yang menyebabkan MSI sporadis.
- ·Definisi bervariasi antar penelitian, dan glioma CIMP adalah fenomena terpisah yang dipicu oleh IDH.
Tempatkan gen-gen ini dalam konteks jalur
Pertanyaan yang sering diajukan
Apa yang ditunjukkan oleh hasil CIMP-tinggi pada kanker kolorektal?
Hal ini sangat terkait dengan mutasi BRAF V600E dan pembungkaman MLH1 yang dipicu oleh metilasi, yang merupakan mekanisme umum di balik ketidakstabilan mikrosatelit sporadis (non-Lynch).
Apakah status CIMP digunakan untuk memilih pengobatan?
Tidak secara langsung. Hal ini terutama digunakan dalam penelitian dan untuk mengetahui apakah ketidakstabilan mikrosatelit bersifat sporadis atau diturunkan.
Apakah CIMP glioma sama dengan CIMP kolorektal?
Tidak. Glioma CIMP didorong oleh mutasi IDH dan berbeda secara biologis, dan tidak ada panel penanda atau ambang batas yang disepakati di seluruh penelitian.
Referensi
Lanjutkan Membaca
Metilasi DNA pada Kanker: Pembungkaman dan Ketidakstabilan
3 menit membaca
MSI-High vs TMB-High: Dua Biomarker Tumor Berbeda
2 menit membaca
Perbaikan Ketidakcocokan DNA dan Sindrom Lynch
4 menit membaca
Mutasi IDH1 dan IDH2: Perubahan Metabolik yang Memperkuat Epigenom
3 menit membaca
Agen Hipometilasi: Azacitidine dan Decitabine
3 menit membaca
Penuaan yang Diinduksi Onkogen: Penghalang Terpasang terhadap Kanker
3 menit membaca
Pilih langkah penelitian Anda berikutnya
Beralih dari penjelasan ini ke profil gen, peta jalur, atau pembaruan bukti berikutnya.
BRAF punya 175+ uji coba yang saat ini dilakukan di ClinicalTrials.gov. Intisari GeneAnalyses merangkum yang baru dan yang diubah setiap hari.