Batas Deteksi: Sinyal Terkecil yang Dapat Disebut Uji Molekuler

Berapa Batas Deteksinya

Batas deteksi adalah jumlah target terendah, biasanya dinyatakan sebagai varian fraksi alel, yang dapat dideteksi oleh pengujian dengan probabilitas yang dinyatakan, biasanya 95 persen, sambil menjaga positif palsu tetap rendah.

Hal ini ditetapkan selama validasi dengan menguji rangkaian pengenceran bahan positif yang diketahui dan merupakan properti pengujian untuk jenis varian dan jumlah masukan tertentu.

Apa yang Mempengaruhinya

Faktor kuncinya adalah kedalaman pengurutan (lebih banyak bacaan membedakan sinyal tingkat rendah yang sebenarnya dari kesalahan), tingkat kesalahan latar belakang kimia dan bioinformatika, jumlah dan kualitas masukan DNA, dan jenis varian.

Mutasi titik umumnya memiliki batas deteksi terendah; penyisipan, penghapusan, perubahan nomor salinan, dan penggabungan lebih sulit dan memiliki batas yang lebih tinggi (lebih buruk).

Jaringan vs Darah

Panel jaringan tumor standar seringkali memiliki batas deteksi sekitar 2 hingga 5 persen varian fraksi alel. Tes DNA tumor khusus yang bersirkulasi menghasilkan angka yang jauh lebih rendah, hingga 0,1 persen atau lebih rendah, menggunakan koreksi kesalahan dan dengan melacak banyak varian secara bersamaan.

Uji penyakit sisa yang sangat sensitif mencapai sensitivitasnya sebagian dengan cara dipersonalisasikan pada serangkaian mutasi tumor yang sudah diketahui, dibandingkan melakukan penelusuran secara luas.

Mengapa Ini Mengatur Hasil Negatif

Jika mutasi terdapat pada 1 persen dan batas deteksi pengujian adalah 5 persen, pengujian akan melaporkan negatif meskipun mutasi tersebut ada. Hasil negatifnya akurat untuk pemeriksaan ini tetapi tidak untuk tumornya.

Inilah sebabnya mengapa mutasi yang diharapkan secara klinis namun tidak ditemukan harus dipertimbangkan kembali berdasarkan kemurnian sampel dan batas deteksi pengujian sebelum menyimpulkan ketidakhadiran yang sebenarnya.

Catatan Interpretasi

Laporan harus menyatakan batas deteksi pengujian, idealnya berdasarkan jenis varian. Anggaplah hasil negatif sebagai mengesampingkan varian yang hanya berada di atas ambang batas tersebut.

Untuk sampel dengan kandungan tumor rendah atau tes berbasis darah, sensitivitas efektif untuk kasus tertentu bisa lebih buruk daripada batas deteksi utama.

Poin Penting

• ·Batas deteksi adalah pecahan varian terendah yang dapat diandalkan oleh suatu pengujian, yang ditetapkan selama validasi.
• ·Kedalaman, tingkat kesalahan, kualitas masukan, dan jenis varian semuanya memengaruhinya.
• ·Panel tisu berukuran sekitar 2 hingga 5 persen; tes ctDNA khusus mencapai 0,1 persen atau lebih rendah.
• ·Hasil negatif hanya mengecualikan varian di atas batas deteksi pengujian.