Валидация анализа биомаркеров: почему важен результат теста
Результат биомаркера настолько надежен, насколько надежен анализ, в результате которого он был получен. Валидация – это формальный процесс демонстрации того, что анализ воспроизводимо измеряет то, на что он заявлен, и что результат имеет какое-то клиническое значение. Аналитическая и клиническая проверка — это отдельные этапы, и оба имеют значение.
Быстрый ответ
Результат биомаркера настолько надежен, насколько надежен анализ, в результате которого он был получен. Валидация – это формальный процесс демонстрации того, что анализ воспроизводимо измеряет то, на что он заявлен, и что результат имеет какое-то клиническое значение. Аналитическая и клиническая проверка — это отдельные этапы, и оба имеют значение.
Аналитическая проверка: правильно ли измеряет анализ?
Аналитическая валидация устанавливает технические характеристики: точность (вызывает ли анализ правильный вариант), прецизионность и воспроизводимость (одинаковый ответ при повторном тестировании, для всех операторов и инструментов), аналитическую чувствительность (наименьшая обнаруживаемая доля варианта или предел обнаружения) и специфичность (небольшое количество ложноположительных результатов).
Он также определяет объем анализа: какие типы вариантов (замены, вставки и делеции, число копий, слияния) и какие области генома надежно охвачены, а где производительность падает.
Клиническая проверка: означает ли результат что-то
Клиническая проверка показывает, что результат анализа коррелирует с клиническим состоянием или исходом, например, что данный вызов мутации предсказывает ответ на конкретное лекарственное средство в определенной популяции.
Аналитически превосходный анализ может все еще не иметь клинической валидации для конкретного применения. Сообщение о маркере, который анализ хорошо обнаруживает, но клиническое значение которого не доказано, может привести к результату, который никто не знает, как использовать.
Клиническая полезность является дальнейшим шагом
Клиническая полезность заключается в том, действительно ли использование теста улучшает результаты по сравнению с его отсутствием. Биомаркер может быть аналитически и клинически достоверным, но при этом не иметь достаточного значения для управления изменениями.
Эти три понятия — аналитическая валидность, клиническая валидность и клиническая полезность — в маркетинге часто смешиваются, но они различны и оцениваются отдельно.
Аккредитация лабораторий и проверка квалификации
Помимо первоначальной валидации, лаборатории поддерживают качество посредством аккредитации, внутреннего контроля при каждом запуске и внешнего тестирования квалификации, в ходе которого они анализируют слепые образцы и сравниваются с коллегами.
Результат аккредитованной лаборатории, которая участвует в проверке квалификации, имеет больший вес, чем результат, полученный из неаккредитованного источника.
Примечания по интерпретации
В идеале в отчете должны быть указаны подтвержденный объем анализа и предел обнаружения. Отрицательный результат исключает только то, для обнаружения чего был проверен анализ.
Тесты, разработанные в лаборатории, и наборы, одобренные регулирующими органами, могут быть подходящими, но значение имеют валидационные доказательства, лежащие в основе конкретного результата, а не только этикетка.
Ключевые выводы
- ·Аналитическая валидация охватывает точность, воспроизводимость, чувствительность и специфичность и определяет объем анализа.
- ·Клиническая валидация связывает результат с клиническим состоянием или исходом.
- ·Клиническая полезность заключается в том, улучшает ли использование теста результаты; все три отдельные.
- ·Аккредитация и проверка квалификации поддерживают качество после первоначальной проверки.
Поместите эти гены в контекст пути.
Часто задаваемые вопросы
Какова ключевая идея валидации анализа биомаркеров: почему важен тест, стоящий за результатом?
Результат биомаркера настолько надежен, насколько надежен анализ, в результате которого он был получен. Валидация – это формальный процесс демонстрации того, что анализ воспроизводимо измеряет то, на что он заявлен, и что результат имеет какое-то клиническое значение. Аналитическая и клиническая проверка — это отдельные этапы, и оба имеют значение.
Что следует сохранить вместе с результатом или механизмом?
Клиническая валидация связывает результат с клиническим состоянием или исходом. Клиническая полезность заключается в том, улучшает ли использование теста результаты; все три отдельные. Аккредитация и проверка квалификации поддерживают качество после первоначальной проверки.
Ссылки
- 1Рекомендации по валидации онкологических панелей нового поколения на основе секвенирования: совместный консенсус. Журнал молекулярной диагностики, 2017. PubMed
- 2Панели соматических мутаций: время очистить свои имена. Генетика рака, 2019. PubMed
- 3Обновленное руководство по молекулярному тестированию для отбора пациентов с раком легких для лечения таргетными ингибиторами тирозинкиназы. Архивы патологии и лабораторной медицины, 2018. PubMed
- 4Сопутствующая и дополнительная диагностика: клинические и нормативные перспективы. Тенденции развития рака, 2016. PubMed
Продолжить чтение
Подтверждение результатов секвенирования: когда необходимо ортогональное тестирование
3 минуты чтения
Предел обнаружения: наименьший сигнал, который может обнаружить молекулярный анализ
3 минуты чтения
Панели NGS против тестирования горячих точек: широта и фокус
3 минуты чтения
Сопутствующая диагностика: тесты, привязанные к конкретному лечению
3 минуты чтения
Лимфоциты, инфильтрирующие опухоль: прогноз и предсказание
3 минуты чтения
Чистота опухоли и секвенирование: сколько рака содержится в образце
3 минуты чтения
Выберите следующий шаг исследования
Перейдите от этого объяснения к профилю генов, карте путей или следующему обновлению данных.
EGFR имеет 1000+ клинические испытания, которые в настоящее время набираются на ClinicalTrials.gov. Дайджест GeneAnalyses суммирует новые и измененные каждый день.