Все статьи
Генетика рака· 3 минуты чтения

Валидация анализа биомаркеров: почему важен результат теста

Результат биомаркера настолько надежен, насколько надежен анализ, в результате которого он был получен. Валидация – это формальный процесс демонстрации того, что анализ воспроизводимо измеряет то, на что он заявлен, и что результат имеет какое-то клиническое значение. Аналитическая и клиническая проверка — это отдельные этапы, и оба имеют значение.

Быстрый ответ

Результат биомаркера настолько надежен, насколько надежен анализ, в результате которого он был получен. Валидация – это формальный процесс демонстрации того, что анализ воспроизводимо измеряет то, на что он заявлен, и что результат имеет какое-то клиническое значение. Аналитическая и клиническая проверка — это отдельные этапы, и оба имеют значение.

Валидация анализа биомаркеров: почему важен результат теста: механизм и карта интерпретацииТри связанных этапа суммируют механизм статьи, измеряемый эффект и границы интерпретации.EGFR · KRAS · BRCA11Аналитическая проверка: имеет ли…Механизм2Клиническая проверка: есть ли…Наблюдаемое последствие3Клиническая полезность является дальнейшим…Интерпретировать в контекстеДоказательства гена или пути → измеренный фенотип → заключение, основанное на анализе
Карта механизма: основные биологические стадии в статье отделены от окончательной интерпретации, поэтому взаимосвязь путей не может быть ошибочно принята за клиническое заключение.

Аналитическая проверка: правильно ли измеряет анализ?

Аналитическая валидация устанавливает технические характеристики: точность (вызывает ли анализ правильный вариант), прецизионность и воспроизводимость (одинаковый ответ при повторном тестировании, для всех операторов и инструментов), аналитическую чувствительность (наименьшая обнаруживаемая доля варианта или предел обнаружения) и специфичность (небольшое количество ложноположительных результатов).

Он также определяет объем анализа: какие типы вариантов (замены, вставки и делеции, число копий, слияния) и какие области генома надежно охвачены, а где производительность падает.

Клиническая проверка: означает ли результат что-то

Клиническая проверка показывает, что результат анализа коррелирует с клиническим состоянием или исходом, например, что данный вызов мутации предсказывает ответ на конкретное лекарственное средство в определенной популяции.

Аналитически превосходный анализ может все еще не иметь клинической валидации для конкретного применения. Сообщение о маркере, который анализ хорошо обнаруживает, но клиническое значение которого не доказано, может привести к результату, который никто не знает, как использовать.

Клиническая полезность является дальнейшим шагом

Клиническая полезность заключается в том, действительно ли использование теста улучшает результаты по сравнению с его отсутствием. Биомаркер может быть аналитически и клинически достоверным, но при этом не иметь достаточного значения для управления изменениями.

Эти три понятия — аналитическая валидность, клиническая валидность и клиническая полезность — в маркетинге часто смешиваются, но они различны и оцениваются отдельно.

Аккредитация лабораторий и проверка квалификации

Помимо первоначальной валидации, лаборатории поддерживают качество посредством аккредитации, внутреннего контроля при каждом запуске и внешнего тестирования квалификации, в ходе которого они анализируют слепые образцы и сравниваются с коллегами.

Результат аккредитованной лаборатории, которая участвует в проверке квалификации, имеет больший вес, чем результат, полученный из неаккредитованного источника.

Исследуйте:EGFR

Примечания по интерпретации

В идеале в отчете должны быть указаны подтвержденный объем анализа и предел обнаружения. Отрицательный результат исключает только то, для обнаружения чего был проверен анализ.

Тесты, разработанные в лаборатории, и наборы, одобренные регулирующими органами, могут быть подходящими, но значение имеют валидационные доказательства, лежащие в основе конкретного результата, а не только этикетка.

Ключевые выводы

  • ·Аналитическая валидация охватывает точность, воспроизводимость, чувствительность и специфичность и определяет объем анализа.
  • ·Клиническая валидация связывает результат с клиническим состоянием или исходом.
  • ·Клиническая полезность заключается в том, улучшает ли использование теста результаты; все три отдельные.
  • ·Аккредитация и проверка квалификации поддерживают качество после первоначальной проверки.

Поместите эти гены в контекст пути.

Часто задаваемые вопросы

Какова ключевая идея валидации анализа биомаркеров: почему важен тест, стоящий за результатом?

Результат биомаркера настолько надежен, насколько надежен анализ, в результате которого он был получен. Валидация – это формальный процесс демонстрации того, что анализ воспроизводимо измеряет то, на что он заявлен, и что результат имеет какое-то клиническое значение. Аналитическая и клиническая проверка — это отдельные этапы, и оба имеют значение.

Что следует сохранить вместе с результатом или механизмом?

Клиническая валидация связывает результат с клиническим состоянием или исходом. Клиническая полезность заключается в том, улучшает ли использование теста результаты; все три отдельные. Аккредитация и проверка квалификации поддерживают качество после первоначальной проверки.

Ссылки

  1. 1Рекомендации по валидации онкологических панелей нового поколения на основе секвенирования: совместный консенсус. Журнал молекулярной диагностики, 2017. PubMed
  2. 2Панели соматических мутаций: время очистить свои имена. Генетика рака, 2019. PubMed
  3. 3Обновленное руководство по молекулярному тестированию для отбора пациентов с раком легких для лечения таргетными ингибиторами тирозинкиназы. Архивы патологии и лабораторной медицины, 2018. PubMed
  4. 4Сопутствующая и дополнительная диагностика: клинические и нормативные перспективы. Тенденции развития рака, 2016. PubMed

Продолжить чтение

Выберите следующий шаг исследования

Перейдите от этого объяснения к профилю генов, карте путей или следующему обновлению данных.

EGFR имеет 1000+ клинические испытания, которые в настоящее время набираются на ClinicalTrials.gov. Дайджест GeneAnalyses суммирует новые и измененные каждый день.