Фенотип метилатора CpG-островков (CIMP)
В некоторых опухолях наблюдается одновременное метилирование многих промоторов CpG-островков, что гораздо больше, чем ожидалось случайно. Этот фенотип метилатора CpG-островков, или CIMP, был впервые описан при колоректальном раке и с тех пор сообщалось при глиоме, раке желудка и других видах рака, хотя его определение варьируется в зависимости от исследования.
Быстрый ответ
В некоторых опухолях наблюдается одновременное метилирование многих промоторов CpG-островков, что гораздо больше, чем ожидалось случайно. Этот фенотип метилатора CpG-островков, или CIMP, был впервые описан при колоректальном раке и с тех пор сообщалось при глиоме, раке желудка и других видах рака, хотя его определение варьируется в зависимости от исследования.
Часть тематического кластера
Эпигенетика рака и регуляторы хроматина
Открыть полное руководство из 15 статей.Скоординированная программа метилирования
CIMP идентифицируют путем тестирования панели маркерных локусов; опухоль, метилированная у большинства из них, называется CIMP-высоким. Фенотип подразумевает, что что-то систематически стимулирует метилирование промотора, а не серию независимых событий.
При колоректальном раке опухоли с высоким уровнем CIMP тесно связаны с мутацией BRAF V600E и возникают преимущественно из сидячих зубчатых поражений, а не из обычных аденом.
Связь с MLH1 и микросателлитной нестабильностью
Основным последствием CIMP при колоректальном раке является метилирование промотора MLH1, которое подавляет этот ген репарации ошибочного спаривания и вызывает спорадическую микросателлитную нестабильность. Именно этот механизм лежит в основе большинства случаев колоректального рака с высоким уровнем MSI, не связанных с синдромом Линча.
Таким образом, профиль опухоли с высоким уровнем CIMP, мутантным BRAF и метилированным MLH1 свидетельствует против наследственной причины, тогда как MSI без этих особенностей повышает вероятность синдрома Линча.
Предостережения
Не существует единой согласованной панели маркеров или порогового значения для CIMP, поэтому распространенность и прогностические связи различаются в зависимости от исследований и типов рака. CIMP при глиоме (связанный с мутацией IDH) биологически отличается от колоректального CIMP.
Статус CIMP в основном используется в исследованиях и для интерпретации происхождения микросателлитной нестабильности, а не в качестве прямого выбора лечения.
Как CIMP обеспечивает интерпретацию
Практическая польза от оценки CIMP при колоректальном раке заключается в интерпретации микросателлитной нестабильности. Высокий уровень CIMP, BRAF V600E, метилированный MLH1 паттерн указывает на спорадическую причину и выступает против синдрома Линча, избавляя от ненужного тестирования зародышевой линии, тогда как микросателлитная нестабильность без этих особенностей оставляет наследственную причину под вопросом.
Сам по себе CIMP не используется для выбора лекарственного средства. Колоректальный рак с мутацией BRAF, который в значительной степени перекрывается с заболеванием с высоким уровнем CIMP, лечится ингибитором BRAF плюс антителом против EGFR, но это решение зависит от результата BRAF, а не от фенотипа метилатора.
Ключевые выводы
- ·CIMP описывает скоординированное гиперметилирование многих промоторных CpG-островков в опухоли.
- ·Колоректальный CIMP связан с BRAF V600E и с подавлением MLH1, вызывая спорадический MSI.
- ·Определения различаются в разных исследованиях, и CIMP глиомы представляет собой отдельный феномен, обусловленный IDH.
Поместите эти гены в контекст пути.
Часто задаваемые вопросы
О чем говорит высокий результат CIMP при колоректальном раке?
Он тесно связан с мутацией BRAF V600E и с вызванным метилированием молчанием MLH1, которое является обычным механизмом, лежащим в основе спорадической (нелинчевской) микросателлитной нестабильности.
Используется ли статус CIMP для выбора лечения?
Не напрямую. В основном он используется в исследованиях и для определения того, является ли микросателлитная нестабильность спорадической или наследственной.
Является ли CIMP при глиоме тем же, что и при колоректальном CIMP?
Нет. Глиома CIMP обусловлена мутацией IDH и биологически отлична, и во всех исследованиях не существует единой согласованной панели маркеров или порогового значения.
Ссылки
Продолжить чтение
Метилирование ДНК при раке: подавление и нестабильность
3 минуты чтения
MSI-High против TMB-High: два разных опухолевых биомаркера
2 минуты чтения
Репарация несоответствия ДНК и синдром Линча
4 минуты чтения
Мутации IDH1 и IDH2: метаболическое изменение, которое перестраивает эпигеном
3 минуты чтения
Гипометилирующие агенты: азацитидин и децитабин.
3 минуты чтения
Вызванное онкогенами старение: встроенный барьер на пути рака
3 минуты чтения
Выберите следующий шаг исследования
Перейдите от этого объяснения к профилю генов, карте путей или следующему обновлению данных.
BRAF имеет 175+ клинические испытания, которые в настоящее время набираются на ClinicalTrials.gov. Дайджест GeneAnalyses суммирует новые и измененные каждый день.