Иммунология рака· 2 минуты чтения

Мутационное бремя опухоли: как измеряется TMB

Мутационная нагрузка опухоли (TMB) представляет собой количество мутаций в пределах количества секвенированной ДНК. Это метрика, полученная с помощью вычислений, сообщаемое значение которой зависит от размера панели, фильтрации и выбора конвейера.

TP53 BRCA1 ATM

Быстрый ответ

Карта механизма: основные биологические стадии в статье отделены от окончательной интерпретации, поэтому взаимосвязь путей не может быть ошибочно принята за клиническое заключение.

Счет со знаменателем

TMB часто выражается в виде мутаций на мегабазу. Оценки всего экзома и целевой панели являются связанными, но не идентичными измерениями.

Почему платформы различаются

На оценку влияют ширина панели, фильтрация вариантов, обработка зародышевой линии и биоинформатика. Для межплатформенного сравнения требуется калибровка с учетом анализа, а не простое сопоставление чисел.

Ключевые выводы

·TMB зависит от анализа.
·Для значения необходимы его единица измерения, панель и метод.
·TMB и MSI представляют собой отдельные биомаркеры.

Поместите эти гены в контекст пути.

Реакция на повреждение ДНК Гомологичная рекомбинационная репарация Регуляция клеточного цикла

Часто задаваемые вопросы

Какова ключевая идея в книге «Мутационная нагрузка опухоли: как измеряется TMB»?

Что следует сохранить вместе с результатом или механизмом?

TMB зависит от анализа. Для значения нужны его единица измерения, панель и метод. TMB и MSI являются отдельными биомаркерами.

Ссылки

1Проект гармонизации TMB. Анналы онкологии, 2021. PubMed
2ТМВ как биомаркер. Nature Reviews Клиническая онкология, 2019. PubMed
3Эволюция клонов рака. Обзоры природы Генетика, 2015. PubMed

Продолжить чтение

Мутационные сигнатуры: чтение истории опухоли

3 минуты чтения

Неоантигены и иммуногенность опухолей

3 минуты чтения

Объяснение тестирования PD-L1: анализы, оценки и пределы

2 минуты чтения

Клональная эволюция и геномная нестабильность при раке

4 минуты чтения

Репарация несоответствия ДНК и синдром Линча

4 минуты чтения

MSI-High против TMB-High: два разных опухолевых биомаркера

2 минуты чтения

Выберите следующий шаг исследования

Перейдите от этого объяснения к профилю генов, карте путей или следующему обновлению данных.

Исследуйте TP53 Контекст открытого пути Отслеживание испытаний TP53

TP53 имеет 100+ клинические испытания, которые в настоящее время набираются на ClinicalTrials.gov. Дайджест GeneAnalyses суммирует новые и измененные каждый день.