Все статьи
Прецизионная онкология· 3 минуты чтения

Горячие точки мутации PIK3CA: изменения спирального и киназного домена

PIK3CA — один из наиболее часто мутирующих генов при раке, и его мутации поразительно сконцентрированы в нескольких позициях. Понимание того, почему существуют эти горячие точки и что они активируют PI3K более чем одним механизмом, помогает прочитать молекулярный отчет.

Быстрый ответ

PIK3CA — один из наиболее часто мутирующих генов при раке, и его мутации поразительно сконцентрированы в нескольких позициях. Понимание того, почему существуют эти горячие точки и что они активируют PI3K более чем одним механизмом, помогает прочитать молекулярный отчет.

Горячие точки мутации PIK3CA: изменения спирального и киназного домена: механизм и карта интерпретацииТри связанных этапа суммируют механизм статьи, измеряемый эффект и границы интерпретации.PIK3CA · PTEN · AKT11Структура р110-альфаМеханизм2Горячие точки спирального домена…Наблюдаемое последствие3Горячая точка киназного домена (H1047R)Интерпретировать в контекстеДоказательства гена или пути → измеренный фенотип → заключение, основанное на анализе
Карта механизма: основные биологические стадии в статье отделены от окончательной интерпретации, поэтому взаимосвязь путей не может быть ошибочно принята за клиническое заключение.

Структура р110-альфа

PIK3CA кодирует p110-альфа, каталитическую субъединицу PI3K, которая обычно контролируется регуляторной субъединицей p85. p110-альфа имеет несколько доменов, включая спиральный домен и С-концевой киназный домен.

Раковые мутации нарушают ограничения фермента, а не создают новую активность, поэтому они группируются там, где устанавливаются регуляторные контакты.

Горячие точки спирального домена (E542K, E545K)

Мутации кодонов 542 и 545 в спиральном домене нарушают ингибирующий контакт между p110-альфа и p85. Это освобождает фермент от подавления, опосредованного p85, сохраняя при этом его зависимость от RAS-GTP в значительной степени неизменной.

Эти мутации являются одними из наиболее распространенных изменений PIK3CA при раке молочной железы и других видах рака.

Исследуйте:PIK3CA

Горячая точка киназного домена (H1047R)

Мутация H1047R в киназном домене действует по-другому. Он меняет ориентацию каталитической области и ее взаимодействие с мембраной, увеличивая активность способом, который в значительной степени не зависит от связывания RAS.

Таким образом, H1047R и мутации спирального домена могут иметь несколько разную передачу сигналов и, в лабораторных моделях, разную чувствительность к специфическим ингибиторам.

Отсутствие горячих точек и множественные мутации

Помимо классических «горячих точек», по всему гену встречаются более редкие активирующие мутации, а некоторые опухоли несут две мутации PIK3CA в одном и том же аллеле, которые могут вызывать более сильную активацию пути, чем любая из них по отдельности.

Анализы, которые сообщают только об общих «горячих точках», могут их не заметить, поэтому широта теста имеет значение, когда результат отрицательный.

Тестирование и интерпретация

Для тестирования PIK3CA на пригодность алпелисиба при раке молочной железы можно использовать опухолевую ткань или циркулирующую опухолевую ДНК, и определенный список активирующих вариантов считается подходящим. Вариант неопределенной значимости при PIK3CA не является квалификационным результатом.

Стоит записать конкретный кодон, фракцию аллеля и наличие более одной мутации PIK3CA.

Ключевые выводы

  • ·Мутации PIK3CA концентрируются в спиральных (E542K, E545K) и киназных (H1047R) «горячих точках».
  • ·Спиральные мутации нарушают сдерживание р85; H1047R изменяет зацепление мембраны.
  • ·Некоторые опухоли несут двойные мутации PIK3CA с более сильной активацией.
  • ·Только определенные активирующие варианты подходят для алпелисиба; ВУС нет.

Поместите эти гены в контекст пути.

Часто задаваемые вопросы

Какова ключевая идея в книге «Горячие точки мутации PIK3CA: изменения спиральных и киназных доменов»?

PIK3CA — один из наиболее часто мутирующих генов при раке, и его мутации поразительно сконцентрированы в нескольких позициях. Понимание того, почему существуют эти горячие точки и что они активируют PI3K более чем одним механизмом, помогает прочитать молекулярный отчет.

Что следует сохранить вместе с результатом или механизмом?

Спиральные мутации нарушают сдерживание р85; H1047R изменяет зацепление мембраны. Некоторые опухоли несут двойные мутации PIK3CA с более сильной активацией. Только определенные активирующие варианты подходят для алпелисиба; ВУС нет.

Ссылки

  1. 1PI3K класса I при онкогенной клеточной трансформации. Онкоген, 2008. PubMed
  2. 2Алпелисиб при распространенном раке молочной железы с мутацией PIK3CA и положительными по рецепторам гормонов. Медицинский журнал Новой Англии, 2019. PubMed
  3. 3Панраковый протеогеномный атлас изменений путей PI3K/AKT/mTOR. Раковая клетка, 2017. PubMed
  4. 4Путь PI3K при раке человека. Nature Reviews Рак, 2017. PubMed

Продолжить чтение

Выберите следующий шаг исследования

Перейдите от этого объяснения к профилю генов, карте путей или следующему обновлению данных.

PIK3CA имеет 50+ клинические испытания, которые в настоящее время набираются на ClinicalTrials.gov. Дайджест GeneAnalyses суммирует новые и измененные каждый день.