Все статьи
Генетика рака· 3 минуты чтения

Потеря SMARCB1 и рабдоидные опухоли

Злокачественные рабдоидные опухоли — это агрессивные виды рака раннего детства, возникающие в почках, головном мозге (где их называют атипичными тератоидными/рабдоидными опухолями) и мягких тканях. Большинство из них вызваны биаллельной потерей одного гена SMARCB1, основной субъединицы комплекса ремоделирования хроматина SWI/SNF.

Быстрый ответ

Злокачественные рабдоидные опухоли — это агрессивные виды рака раннего детства, возникающие в почках, головном мозге (где их называют атипичными тератоидными/рабдоидными опухолями) и мягких тканях. Большинство из них вызваны биаллельной потерей одного гена SMARCB1, основной субъединицы комплекса ремоделирования хроматина SWI/SNF.

Потеря SMARCB1 и рабдоидные опухоли: механизм и карта интерпретацииТри связанных этапа суммируют механизм статьи, измеряемый эффект и границы интерпретации.CDKN2A · MYC1Рак почти без…Механизм2Синдром предрасположенностиНаблюдаемое последствие3Зависимость EZH2Интерпретировать в контекстеДоказательства гена или пути → измеренный фенотип → заключение, основанное на анализе
Карта механизма: основные биологические стадии в статье отделены от окончательной интерпретации, поэтому взаимосвязь путей не может быть ошибочно принята за клиническое заключение.

Часть тематического кластера

Эпигенетика рака и регуляторы хроматина

Открыть полное руководство из 15 статей.

Рак практически без мутаций

Рабдоидные опухоли имеют одно из самых низких мутаций среди всех видов рака человека. В большинстве случаев единственным повторяющимся генетическим событием является потеря обеих аллелей SMARCB1, что демонстрирует, что выключение одной субъединицы ремоделирования хроматина может быть достаточным для запуска агрессивного злокачественного новообразования.

Комплексы SWI/SNF используют АТФ для изменения положения нуклеосом и поддержания доступности усилителей генов дифференцировки. Без SMARCB1 комплекс не может поддерживать эти энхансеры, и клетки остаются в пролиферативном, недифференцированном состоянии.

Синдром предрасположенности

Значительное меньшинство детей с рабдоидными опухолями являются носителями зародышевого варианта SMARCB1 (или, реже, SMARCA4), вызывающего синдром предрасположенности к рабдоидным опухолям. Эти дети, как правило, моложе, и у них могут развиться опухоли более чем в одном месте.

По этой причине детям, у которых диагностирована рабдоидная опухоль, рекомендуется тестирование зародышевой линии, а пострадавшим семьям предлагается генетическое консультирование и наблюдение.

Зависимость EZH2

Клетки с дефицитом SMARCB1 полагаются на противоположную активность комплекса PRC2 и, в частности, на EZH2, чтобы поддерживать свое репрессивное состояние хроматина. Эта синтетическо-летальная связь является основой для тестирования ингибиторов EZH2 при рабдоидных опухолях и связанной с ними эпителиоидной саркоме с дефицитом SMARCB1, где одобрен таземетостат.

Потеря окрашивания SMARCB1 (INI1) по данным иммуногистохимии является стандартным диагностическим тестом.

Путь тестирования и реальность лечения

Диагностической последовательностью является потеря окрашивания SMARCB1 (INI1) при иммуногистохимическом исследовании, подтверждение потери двухаллельного SMARCB1 путем секвенирования или анализа числа копий, а затем тестирование зародышевой линии для выявления синдрома предрасположенности к рабдоидной опухоли. Окрашивание SMARCA4 (BRG1) добавляется, когда SMARCB1 сохраняется, но гистология все еще предполагает рабдоидную опухоль.

Стандартным лечением остается интенсивная мультимодальная терапия — хирургическое вмешательство, химиотерапия и, при необходимости, лучевая терапия — поскольку результаты применения ингибитора EZH2 таземетостата в качестве монотерапии были скромными, особенно при рабдоидных опухолях, и лучше при эпителиоидной саркоме. В испытаниях тестируется таземетостат в комбинации и на более ранних этапах курса.

Ключевые выводы

  • ·Рабдоидные опухоли возникают в основном за счет потери двухаллельного SMARCB1 в почти молчащем геноме.
  • ·Зародышевые варианты SMARCB1 вызывают синдром предрасположенности, поэтому рекомендуется тестирование зародышевой линии.
  • ·Потеря SMARCB1 создает зависимость EZH2, которую используют ингибиторы EZH2 в родственных опухолях.

Поместите эти гены в контекст пути.

Часто задаваемые вопросы

Как рак, практически не имеющий мутаций, может быть настолько агрессивным?

Рабдоидные опухоли показывают, что отключения одной субъединицы ремоделирования хроматина, SMARCB1, достаточно, чтобы удерживать клетки в недифференцированном, пролиферативном состоянии без дополнительных мутаций-драйверов.

Следует ли ребенку с рабдоидной опухолью проходить тестирование на зародышевую линию?

Да. Значительное меньшинство является носителем зародышевого варианта SMARCB1 (или реже SMARCA4), вызывающего синдром предрасположенности к рабдоидной опухоли, который влияет на наблюдение и семейное консультирование.

Почему здесь применимы ингибиторы EZH2?

Клетки с дефицитом SMARCB1 зависят от EZH2 для поддержания репрессивного хроматина, синтетическо-летального отношения; таземетостат одобрен для лечения связанной с ней эпителиоидной саркомы с дефицитом SMARCB1.

Ссылки

  1. 1Грудно-легочные новообразования с дефицитом SWI/SNF. Семин-диагностический патол, 2021. PubMed
  2. 2Нацеливание на EZH2 при раке. Нат Мед, 2016. PubMed
  3. 3Признаки рака: новые измерения. Рак Дисков, 2022. PubMed

Продолжить чтение

Выберите следующий шаг исследования

Перейдите от этого объяснения к профилю генов, карте путей или следующему обновлению данных.

CDKN2A имеет 40+ клинические испытания, которые в настоящее время набираются на ClinicalTrials.gov. Дайджест GeneAnalyses суммирует новые и измененные каждый день.