एआरआईडी1ए और एसडब्ल्यूआई/एसएनएफ कॉम्प्लेक्स: कैंसर में क्रोमैटिन रीमॉडलिंग
एसडब्ल्यूआई/एसएनएफ कॉम्प्लेक्स, जिसे बीएएफ भी कहा जाता है, न्यूक्लियोसोम को खिसकाने और बाहर निकालने के लिए ऊर्जा का उपयोग करता है ताकि डीएनए प्रतिलेखन कारकों के लिए सुलभ हो सके। इसकी उपइकाइयाँ, विशेष रूप से ARID1A, सभी मानव कैंसर के लगभग 20 प्रतिशत में सामूहिक रूप से उत्परिवर्तित होती हैं, जिससे क्रोमैटिन रीमॉडलिंग कैंसर में सबसे आम तौर पर बाधित प्रक्रियाओं में से एक बन जाती है।
त्वरित उत्तर
एसडब्ल्यूआई/एसएनएफ कॉम्प्लेक्स, जिसे बीएएफ भी कहा जाता है, न्यूक्लियोसोम को खिसकाने और बाहर निकालने के लिए ऊर्जा का उपयोग करता है ताकि डीएनए प्रतिलेखन कारकों के लिए सुलभ हो सके। इसकी उपइकाइयाँ, विशेष रूप से ARID1A, सभी मानव कैंसर के लगभग 20 प्रतिशत में सामूहिक रूप से उत्परिवर्तित होती हैं, जिससे क्रोमैटिन रीमॉडलिंग कैंसर में सबसे आम तौर पर बाधित प्रक्रियाओं में से एक बन जाती है।
एसडब्ल्यूआई/एसएनएफ क्या करता है
न्यूक्लियोसोम बनाने के लिए डीएनए को हिस्टोन ऑक्टामर्स के चारों ओर लपेटा जाता है, जो डिफ़ॉल्ट रूप से नियामक अनुक्रमों तक पहुंच को अवरुद्ध करता है। एसडब्ल्यूआई/एसएनएफ कॉम्प्लेक्स अपने उत्प्रेरक सबयूनिट (SMARCA4 या SMARCA2) के माध्यम से प्रमोटरों और एन्हांसरों पर न्यूक्लियोसोम को पुनर्स्थापित करने या हटाने के लिए एटीपी को हाइड्रोलाइज करता है।
यह इसे वंश-विशिष्ट जीन अभिव्यक्ति, विभेदन और, कुछ संदर्भों में, ट्यूमर-दबाने वाले कार्यक्रमों और डीएनए मरम्मत की गतिविधि के लिए आवश्यक बनाता है।
ट्यूमर शमनकर्ता के रूप में ARID1A
ARID1A एक डीएनए-बाइंडिंग सबयूनिट है जो कॉम्प्लेक्स को विशिष्ट साइटों पर लक्षित करने में मदद करता है। कार्य में कमी ARID1A उत्परिवर्तन सबसे आम SWI/SNF घाव हैं और डिम्बग्रंथि स्पष्ट कोशिका और एंडोमेट्रियोइड कार्सिनोमा, एंडोमेट्रियल कैंसर, गैस्ट्रिक कैंसर, मूत्राशय कैंसर और कोलेजनियोकार्सिनोमा में पुनरावृत्ति करते हैं।
अधिकांश एआरआईडी1ए उत्परिवर्तन छोटे हो रहे हैं और प्रोटीन की हानि का कारण बन रहे हैं, जिसका पता इम्यूनोहिस्टोकेमिस्ट्री द्वारा लगाया जा सकता है और कुछ ट्यूमर में निदान के लिए इसका उपयोग किया जाता है।
अन्य सबयूनिट और विशिष्ट कैंसर
SMARCB1 हानि घातक रबडॉइड ट्यूमर और एपिथेलिओइड सार्कोमा को परिभाषित करती है। SMARCA4 हानि अंडाशय हाइपरकैलेमिक प्रकार के छोटे सेल कार्सिनोमा और आक्रामक वक्ष ट्यूमर के एक उपसमूह को प्रेरित करती है। क्लियर सेल रीनल सेल कार्सिनोमा में पीबीआरएम1 हानि आम है।
प्रत्येक सबयूनिट हानि एक विशिष्ट ट्यूमर स्पेक्ट्रम उत्पन्न करती है, इसलिए विशिष्ट जीन मायने रखता है।
उभरती कमजोरियाँ
एसडब्ल्यूआई/एसएनएफ-उत्परिवर्ती कैंसर अवशिष्ट जटिल गतिविधि या क्षतिपूर्ति मार्गों पर निर्भर हो सकते हैं। ARID1A की कमी वाली कोशिकाएं कुछ मॉडलों में समानांतर ARID1B के निषेध, EZH2 अवरोधकों, PARP और ATR अवरोधकों के प्रति संवेदनशीलता दिखाती हैं, और प्रतिरक्षा-चेकपॉइंट नाकाबंदी के प्रति परिवर्तित प्रतिक्रिया दिखाती हैं।
SMARCB1- या SMARCA4 की कमी वाले ट्यूमर का इलाज EZH2 अवरोधकों के साथ किया जा रहा है, जिसमें एपिथेलिओइड सार्कोमा के लिए टैज़ेमेटोस्टैट को मंजूरी दी गई है। अधिकांश अन्य दृष्टिकोण जांचात्मक बने हुए हैं।
व्याख्या नोट्स
एक SWI/SNF सबयूनिट परिवर्तन को विशेष रूप से पहचाना जाना चाहिए (ARID1A बनाम SMARCB1 बनाम SMARCA4 और इसी तरह), क्योंकि ट्यूमर एसोसिएशन और कोई चिकित्सीय लीड भिन्न होते हैं।
इम्यूनोहिस्टोकेमिस्ट्री द्वारा सबयूनिट प्रोटीन का नुकसान कार्यात्मक निष्क्रियता का समर्थन करता है, अनुक्रमण का पूरक है।
मुख्य बातें
- ·एसडब्ल्यूआई/एसएनएफ (बीएएफ) न्यूक्लियोसोम को पुनर्स्थापित करने और नियामक डीएनए को खोलने के लिए एटीपी का उपयोग करता है।
- ·लगभग 20 प्रतिशत कैंसर में इसकी उपइकाइयाँ सामूहिक रूप से उत्परिवर्तित होती हैं; ARID1A हानि सबसे आम है।
- ·विभिन्न सबयूनिट हानियाँ (SMARCB1, SMARCA4, PBRM1) विभिन्न ट्यूमर प्रकारों को परिभाषित करती हैं।
- ·सिंथेटिक-घातक लीड में EZH2, ARID1B और डीएनए-क्षति-प्रतिक्रिया लक्ष्यीकरण शामिल हैं, जो ज्यादातर जांच पर आधारित हैं।
इन जीनों को मार्ग संदर्भ में रखें
अक्सर पूछे जाने वाले प्रश्न
ARID1A और SWI/SNF कॉम्प्लेक्स में मुख्य विचार क्या है: कैंसर में क्रोमैटिन रीमॉडलिंग?
एसडब्ल्यूआई/एसएनएफ कॉम्प्लेक्स, जिसे बीएएफ भी कहा जाता है, न्यूक्लियोसोम को खिसकाने और बाहर निकालने के लिए ऊर्जा का उपयोग करता है ताकि डीएनए प्रतिलेखन कारकों के लिए सुलभ हो सके। इसकी उपइकाइयाँ, विशेष रूप से ARID1A, सभी मानव कैंसर के लगभग 20 प्रतिशत में सामूहिक रूप से उत्परिवर्तित होती हैं, जिससे क्रोमैटिन रीमॉडलिंग कैंसर में सबसे आम तौर पर बाधित प्रक्रियाओं में से एक बन जाती है।
परिणाम या तंत्र के साथ क्या रखा जाना चाहिए?
लगभग 20 प्रतिशत कैंसर में इसकी उपइकाइयाँ सामूहिक रूप से उत्परिवर्तित होती हैं; ARID1A हानि सबसे आम है। विभिन्न सबयूनिट हानियाँ (SMARCB1, SMARCA4, PBRM1) विभिन्न ट्यूमर प्रकारों को परिभाषित करती हैं। सिंथेटिक-घातक लीड में EZH2, ARID1B और डीएनए-क्षति-प्रतिक्रिया लक्ष्यीकरण शामिल हैं, जो ज्यादातर जांचात्मक हैं।
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