PI3K पाथवे बायोमार्कर: PIK3CA, PTEN, AKT1 और उससे आगे

एक मार्ग, अनेक प्रवेश बिंदु

PI3K लिपिड PIP3 का उत्पादन करता है, जो सक्रियण के लिए झिल्ली में AKT को भर्ती करता है; पीटीईएन ने पीआईपी3 को हटा दिया और पूरी प्रक्रिया का विरोध किया। डाउनस्ट्रीम, AKT और mTORC1 विकास, चयापचय और उत्तरजीविता को संचालित करते हैं।

क्योंकि पाथवे को रिसेप्टर पर, पीआई3के पर, पीटीईएन खोकर, या एकेटी पर स्विच किया जा सकता है, कोई भी जीन परीक्षण पाथवे की स्थिति को पकड़ नहीं पाता है। रिपोर्टें अक्सर कई निष्कर्षों को सूचीबद्ध करती हैं जिन्हें एक साथ तौलने की आवश्यकता होती है।

PIK3CA उत्परिवर्तन

PIK3CA PI3K के p110-अल्फा कैटेलिटिक सबयूनिट को एनकोड करता है। कुछ हॉटस्पॉट पर सक्रिय उत्परिवर्तन क्लस्टर होते हैं और स्तन, एंडोमेट्रियल, कोलोरेक्टल, सिर और गर्दन और गर्भाशय ग्रीवा के कैंसर में आम होते हैं।

हार्मोन-रिसेप्टर-पॉजिटिव, एचईआर2-नकारात्मक उन्नत स्तन कैंसर में, ट्यूमर ऊतक या परिसंचारी ट्यूमर डीएनए में एक PIK3CA सक्रिय उत्परिवर्तन का उपयोग PI3K-अल्फा अवरोधक एल्पेलिसिब का चयन करने के लिए किया जाता है। उस सेटिंग के बाहर पूर्वानुमानित मान कम स्थापित होता है।

पीटीईएन हानि

पीटीईएन को उत्परिवर्तन, विलोपन या अन्य तंत्रों के माध्यम से कम प्रोटीन अभिव्यक्ति द्वारा खोया जा सकता है। इन्हें क्रमशः अनुक्रमण, प्रतिलिपि-संख्या विश्लेषण और इम्यूनोहिस्टोकेमिस्ट्री द्वारा पता लगाया जाता है, और वे हमेशा सहमत नहीं होते हैं।

पीटीईएन हानि मार्ग को संवैधानिक रूप से सक्रिय करती है और इसे एकेटी अवरोधकों के लिए बायोमार्कर के रूप में खोजा गया है, लेकिन परख मानकीकरण और स्कोरिंग चुनौतियां बनी हुई हैं, इसलिए विधि को हमेशा परिणाम के साथ होना चाहिए।

AKT1 और अन्य परिवर्तन

आवर्तक AKT1 E17K उत्परिवर्तन सीधे AKT की झिल्ली बाइंडिंग को बदलकर सक्रिय करता है। यह असामान्य है लेकिन स्तन, एंडोमेट्रियल और अन्य कैंसर में पाया जाता है। AKT2 और AKT3 प्रवर्धन भी होते हैं।

CAPItello-291 परीक्षण में, फुलवेस्ट्रेंट के साथ AKT अवरोधक कैपिवासर्टिब ने PIK3CA, AKT1 या PTEN परिवर्तनों के साथ हार्मोन-रिसेप्टर-पॉजिटिव स्तन कैंसर में लाभ दिखाया, उन्हें एक संयुक्त मार्ग-परिवर्तित समूह के रूप में माना गया।

पाथवे रिपोर्ट पढ़ना

ध्यान दें कि कौन सा जीन बदला गया है, विशिष्ट प्रकार या प्रतिलिपि-संख्या बदल गई है, परख का उपयोग किया गया है, और क्या नमूना ऊतक या रक्त था। कम एलील अंश पर एक सबक्लोनल वैरिएंट क्लोनल ड्राइवर के समान नहीं है।

सह-घटित परिवर्तन मायने रखते हैं: उदाहरण के लिए, समवर्ती पीटीईएन हानि पूर्वव्यापी विश्लेषणों में कुछ मार्ग अवरोधकों से कम लाभ के साथ जुड़ी हुई है।

मुख्य बातें

• ·पीआई3के मार्ग को कई बिंदुओं पर सक्रिय किया जा सकता है, इसलिए कोई भी जीन इसकी स्थिति को परिभाषित नहीं करता है।
• ·PIK3CA उत्परिवर्तन एचआर-पॉजिटिव उन्नत स्तन कैंसर में एल्पेलिसिब का चयन करता है।
• ·पीटीईएन हानि विधि-निर्भर है (अनुक्रमण, प्रतिलिपि संख्या, इम्यूनोहिस्टोकेमिस्ट्री)।
• ·कैपिवासर्टिब परीक्षण समूह PIK3CA, AKT1 और PTEN परिवर्तन एक साथ मार्ग-परिवर्तित के रूप में।