Мультигенное панельное тестирование на наследственный рак: что оно добавляет

От одиночных генов к панелям

Затраты на секвенирование настолько упали, что тестирование от 20 до 80 или более генов обходится немногим дороже, чем тестирование одного или двух. Экспертные группы могут выявить наследственную причину, которую целевой тест не упустит, например, обнаружив вариант с репарацией несоответствия у человека, проверенного на наличие генов рака молочной железы.

Исследования пациентов, соответствующих критериям одного синдрома, часто обнаруживают патогенные варианты в неожиданных генах, что является основным аргументом в пользу более широкого подхода.

Вариант компромисса с неопределенной значимостью

Каждый дополнительный проанализированный ген увеличивает вероятность обнаружения варианта, который еще не может быть классифицирован как патогенный или доброкачественный. Таким образом, панели большего размера возвращают больше вариантов неопределенного значения, что может вызвать беспокойство и, в случае неправильного использования, неадекватное управление.

Вариант неопределенной значимости не должен менять тактику лечения. Воздействию подлежат только варианты, классифицированные как патогенные или вероятно патогенные.

Содержание генов не стандартизировано

Панели различаются в разных лабораториях. Некоторые включают только гены с установленным риском, требующим принятия мер; другие добавляют гены с более слабыми или неопределенными доказательствами. Тестирование гена, для которого не существует согласованного руководства по управлению, может дать результат, который никто не знает, как использовать.

Проанализированные гены и классификационная система лаборатории являются частью интерпретации любого отчета комиссии.

Гены высокого, умеренного и неопределенного риска

В группах смешиваются гены с очень разными уровнями риска. BRCA1, BRCA2, TP53 и гены репарации несоответствий несут в себе высокий и четко определенный риск. ATM, CHEK2, BRIP1 и другие несут умеренный риск, который сильно зависит от семейного анамнеза. Некоторые гены на панелях имеют риски, которые еще не определены.

Патогенный вариант в гене умеренного риска не несет тех же последствий, что и вариант в гене высокого риска, и лечение соответственно различается.

Примечания по интерпретации

Результаты панели лучше всего получать при генетическом консультировании, которое помещает конкретный ген и вариант в контекст истории человека и текущих данных.

Отрицательная панель не исключает наследственный риск, поскольку не все гены предрасположенности известны, а некоторые варианты типов трудно обнаружить.

Ключевые выводы

• ·Панели выявляют наследственные причины, которые не видны при тестировании одного гена.
• ·Они также возвращают больше вариантов неопределенного значения, что не должно менять управление.
• ·Содержание генов варьируется в зависимости от лаборатории и влияет на пригодность результата.
• ·Гены высокого, умеренного и неопределенного риска на одной панели не эквивалентны.