एचआरडी स्कोर और जीनोमिक निशान: एचआरडी-सकारात्मक परिणाम का क्या मतलब है
होमोलॉगस रीकॉम्बिनेशन डेफिशिएंसी (एचआरडी) परीक्षण उन ट्यूमर की पहचान करने की कोशिश करता है जो उच्च-निष्ठा वाले डबल-स्ट्रैंड ब्रेक रिपेयर नहीं कर सकते हैं, क्योंकि ये प्लैटिनम कीमोथेरेपी और PARP अवरोधकों के प्रति अधिक संवेदनशील हो सकते हैं। मरम्मत को सीधे मापने के बजाय, अधिकांश परीक्षण जीनोम-व्यापी घावों का पता लगाते हैं जो कमी की अवधि के बाद पीछे छूट जाते हैं।
त्वरित उत्तर
होमोलॉगस रीकॉम्बिनेशन डेफिशिएंसी (एचआरडी) परीक्षण उन ट्यूमर की पहचान करने की कोशिश करता है जो उच्च-निष्ठा वाले डबल-स्ट्रैंड ब्रेक रिपेयर नहीं कर सकते हैं, क्योंकि ये प्लैटिनम कीमोथेरेपी और PARP अवरोधकों के प्रति अधिक संवेदनशील हो सकते हैं। मरम्मत को सीधे मापने के बजाय, अधिकांश परीक्षण जीनोम-व्यापी घावों का पता लगाते हैं जो कमी की अवधि के बाद पीछे छूट जाते हैं।
विषय समूह का हिस्सा
डीएनए मरम्मत और जीनोमिक अस्थिरता
संपूर्ण 15-लेख मार्गदर्शिका खोलेंतीन स्कार मेट्रिक्स
क्लासिक जीनोमिक-स्कार स्कोर तीन जीनोम-व्यापी उपायों को जोड़ता है: मध्यवर्ती आकार की हेटेरोज़ायोसिटी का नुकसान, टेलोमेरिक एलिलिक असंतुलन, और बड़े पैमाने पर राज्य संक्रमण (बदली हुई प्रतिलिपि संख्या के साथ जीनोम के बड़े खंड)। प्रत्येक त्रुटि-प्रवण मरम्मत को दर्शाता है जो सजातीय पुनर्संयोजन विफल होने पर हावी होती है।
इन्हें आम तौर पर एक ही संख्या में जोड़ा जाता है, और एक सीमा एचआरडी-पॉजिटिव को परिभाषित करती है। कुछ जांचों में बीआरसीए1/बीआरसीए2 उत्परिवर्तन परीक्षण जोड़ा जाता है, इसलिए ट्यूमर को एचआरडी-पॉजिटिव कहा जाता है यदि या तो निशान स्कोर अधिक है या रोगजनक बीआरसीए संस्करण मौजूद है।
एक ऐतिहासिक रिकॉर्ड, वर्तमान स्थिति नहीं
भले ही ट्यूमर ने मरम्मत कार्य बहाल कर दिया हो, उदाहरण के लिए बीआरसीए प्रत्यावर्तन उत्परिवर्तन के माध्यम से, निशान बने रहते हैं। इसलिए एक ट्यूमर स्कार-पॉजिटिव हो सकता है, फिर भी उसमें कोई कमी नहीं रह जाती है, जो एक प्रस्तावित कारण है कि कुछ एचआरडी-पॉजिटिव ट्यूमर उम्मीद के मुताबिक प्रतिक्रिया नहीं देते हैं।
नए दृष्टिकोण वर्तमान मरम्मत क्षमता का अनुमान लगाने के लिए उत्परिवर्तन-हस्ताक्षर विश्लेषण या आरएडी51 फोकस गठन जैसे कार्यात्मक रीडआउट जोड़ते हैं।
एचआरडी-पॉजिटिव बीआरसीए-म्यूटेंट नहीं है
बीआरसीए1 प्रमोटर मिथाइलेशन, आरएडी51सी हानि या अन्य घटनाओं जैसे कारणों से किसी भी बीआरसीए उत्परिवर्तन के बिना एचआरडी-सकारात्मक परिणाम उत्पन्न हो सकता है। इसके विपरीत, एटीएम या CHEK2 परिवर्तनों वाले ट्यूमर अक्सर निशान-सकारात्मक नहीं होते हैं, क्योंकि वे जीन क्षति प्रतिक्रिया में पहले कार्य करते हैं और समान पैटर्न उत्पन्न नहीं करते हैं।
लेबल एक विशिष्ट मान्य संदर्भ में एक जीनोमिक फेनोटाइप का वर्णन करता है, और इसका पूर्वानुमानित मूल्य ट्यूमर-प्रकार और परख विशिष्ट है।
वास्तव में एचआरडी परिणाम का उपयोग कैसे किया जाता है
उच्च श्रेणी के सीरस डिम्बग्रंथि कैंसर में, एक मान्य एचआरडी-पॉजिटिव परिणाम (एक उच्च निशान स्कोर या ट्यूमर बीआरसीए उत्परिवर्तन) का उपयोग PARP-अवरोधक रखरखाव से अधिक लाभ की भविष्यवाणी करने और प्लैटिनम संवेदनशीलता के लिए अपेक्षाएं निर्धारित करने में मदद करने के लिए किया जाता है। प्रोस्टेट और अग्नाशय के कैंसर में समग्र स्कोर के बजाय विशिष्ट जीन उत्परिवर्तन पर जोर दिया जाता है, और अधिकांश अन्य ट्यूमर प्रकारों में एचआरडी परीक्षण मानक नहीं है।
एक नकारात्मक या अज्ञात एचआरडी परिणाम सीधे लाभ को बाहर नहीं करता है, और एक सकारात्मक परिणाम इसकी गारंटी नहीं देता है, खासकर जहां एक प्रत्यावर्तन उत्परिवर्तन ने मरम्मत बहाल कर दी है। स्कोर एक पूर्वानुमानित इनपुट है, जिसकी व्याख्या परख और ट्यूमर के प्रकार के भीतर की गई है, जिसमें इसे मान्य किया गया था; दवा पक्ष PARP-अवरोधक गाइड में शामिल है।
मुख्य बातें
- ·एचआरडी स्कोर जीनोम-वाइड स्कारिंग से कमी का अनुमान लगाता है, प्रत्यक्ष मरम्मत माप से नहीं।
- ·निशान एक ऐतिहासिक रिकॉर्ड हैं और ट्यूमर के दोबारा मरम्मत कार्य करने के बाद भी बने रह सकते हैं।
- ·एचआरडी-पॉजिटिव एक जीनोमिक फेनोटाइप है जो बीआरसीए उत्परिवर्तन से अधिक व्यापक है, और इसके बराबर नहीं है।
इन जीनों को मार्ग संदर्भ में रखें
अक्सर पूछे जाने वाले प्रश्न
क्या एचआरडी-पॉजिटिव परिणाम बीआरसीए उत्परिवर्तन के समान है?
नहीं, एचआरडी-पॉजिटिव एक जीनोमिक फेनोटाइप है जो बिना किसी बीआरसीए उत्परिवर्तन के उत्पन्न हो सकता है - बीआरसीए1 प्रमोटर मिथाइलेशन, आरएडी51सी हानि और अन्य कारणों से - और यह बीआरसीए खोज से कहीं अधिक व्यापक है, उसके समकक्ष नहीं।
एचआरडी-पॉजिटिव ट्यूमर अभी भी प्रतिक्रिया क्यों नहीं दे सकता है?
जीनोमिक निशान एक ऐतिहासिक रिकॉर्ड हैं और तब भी बने रहते हैं, जब ट्यूमर की मरम्मत हो गई हो, उदाहरण के लिए बीआरसीए रिवर्सन म्यूटेशन के माध्यम से, इसलिए निशान-पॉजिटिव ट्यूमर अब कम नहीं हो सकता है।
स्कार मेट्रिक्स क्या मापते हैं?
मध्यवर्ती आकार की विषमयुग्मजीता का नुकसान, टेलोमेरिक एलिलिक असंतुलन, और बड़े पैमाने पर प्रतिलिपि-संख्या राज्य संक्रमण - प्रत्येक त्रुटि-प्रवण मरम्मत का एक पदचिह्न है जो सजातीय पुनर्संयोजन विफल होने पर हावी होता है।
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