संपूर्ण-जीनोम दोहरीकरण: कैंसर में एक व्यापक-विकासवादी कदम
संपूर्ण-जीनोम दोहरीकरण एक एकल घटना है जिसमें एक कोशिका अपने संपूर्ण गुणसूत्र पूरक की नकल करती है, प्रत्येक गुणसूत्र की दो प्रतियों से चार की ओर बढ़ती है। लगभग एक तिहाई उन्नत कैंसरों में इसका पता लगाया जा सकता है, यह एक परिवर्तनकारी चालक उत्परिवर्तन के बाद अपेक्षाकृत जल्दी घटित होता है, और कई ट्यूमर प्रकारों में बदतर परिणामों से जुड़ा होता है।
त्वरित उत्तर
संपूर्ण-जीनोम दोहरीकरण एक एकल घटना है जिसमें एक कोशिका अपने संपूर्ण गुणसूत्र पूरक की नकल करती है, प्रत्येक गुणसूत्र की दो प्रतियों से चार की ओर बढ़ती है। लगभग एक तिहाई उन्नत कैंसरों में इसका पता लगाया जा सकता है, यह एक परिवर्तनकारी चालक उत्परिवर्तन के बाद अपेक्षाकृत जल्दी घटित होता है, और कई ट्यूमर प्रकारों में बदतर परिणामों से जुड़ा होता है।
विषय समूह का हिस्सा
डीएनए मरम्मत और जीनोमिक अस्थिरता
संपूर्ण 15-लेख मार्गदर्शिका खोलेंट्यूमर के दोगुना होने से क्या होता है
प्रत्येक जीन की दो के बजाय चार प्रतियों के साथ, एक कोशिका बाद में कार्य-क्षम उत्परिवर्तन और गुणसूत्र हानि को सहन कर सकती है जो अन्यथा घातक होगी। इसलिए संपूर्ण-जीनोम दोहरीकरण एक बफर के रूप में कार्य करता है जो अधिक डाउनस्ट्रीम जीनोमिक अस्थिरता की अनुमति देता है।
यह प्रतिलिपि-संख्या विकास के लिए कच्चा माल भी प्रदान करता है, और दोहरे जीनोम लगभग-ट्रिप्लोइड अवस्था की ओर धीरे-धीरे गुणसूत्र खोते रहते हैं।
एसोसिएशन और पूर्वापेक्षाएँ
संपूर्ण-जीनोम दोहरीकरण टीपी53 उत्परिवर्तन के साथ दृढ़ता से जुड़ा हुआ है, जो असामान्य गुणसूत्र संख्या के साथ प्रसार में आने वाली बाधा को दूर करता है। हालाँकि, दोहरे ट्यूमर का एक बड़ा हिस्सा टीपी53 जंगली-प्रकार का होता है, जिसके बजाय अक्सर ई2एफ-मध्यस्थता वाले जी1 गिरफ्तारी में दोष होते हैं।
इसकी आवृत्ति ट्यूमर वंश के अनुसार भिन्न होती है और प्रसार दर से संबंधित होती है, और यह स्वतंत्र रूप से कई प्रकार के कैंसर में रुग्णता में वृद्धि की भविष्यवाणी करती है।
इसका पता कैसे लगाया जाता है
संपूर्ण-जीनोम दोहरीकरण का अनुमान लगाया जाता है, सीधे तौर पर नहीं मापा जाता है। एल्गोरिदम एलील-विशिष्ट प्रतिलिपि-संख्या राज्यों के वितरण और जीनोम के अंश की जांच करते हैं जो दो या दो से अधिक की प्रमुख-एलील गणना दिखाते हैं ताकि यह तय किया जा सके कि दोहरीकरण हुआ है या नहीं।
समय विश्लेषण घटना को अन्य उत्परिवर्तनों के सापेक्ष रख सकता है। चाहे दोहरीकरण ट्रंकल हो (सभी ट्यूमर कोशिकाओं में) या सबक्लोनल अलग-अलग पूर्वानुमानित भार रखता है, सबक्लोनल दोहरीकरण फेफड़ों के कैंसर में पहले की पुनरावृत्ति से जुड़ा हुआ है।
क्या इससे इलाज बदल जाता है?
संपूर्ण-जीनोम दोहरीकरण स्वयं एक उपचार लक्ष्य नहीं है, और अकेले दोहरीकरण स्थिति पर कोई थेरेपी नहीं चुनी जाती है। इसका मूल्य पूर्वानुमानात्मक है - यह स्वतंत्र रूप से कई कैंसरों में खराब परिणामों की भविष्यवाणी करता है - और यंत्रवत, क्योंकि एक दोगुना, अस्थिर जीनोम वह पृष्ठभूमि है जिसके विरुद्ध प्रतिलिपि-संख्या-संचालित प्रतिरोध विकसित होता है।
अनुसंधान यह परीक्षण कर रहा है कि क्या दोहरे ट्यूमर में शोषण योग्य कमजोरियां हैं, उदाहरण के लिए स्पिंडल-असेंबली चेकपॉइंट पर निर्भरता या उनके असामान्य गुणसूत्र संख्या को सहन करने के लिए विशिष्ट माइटोटिक मोटर प्रोटीन पर निर्भरता। ये प्रयोगशाला-स्तरीय विचार हैं, वर्तमान विकल्प नहीं।
मुख्य बातें
- ·संपूर्ण-जीनोम दोहरीकरण एक घटना में पूरे गुणसूत्र सेट को डुप्लिकेट करता है, बाद में होने वाले नुकसान को बफर करता है।
- ·यह टीपी53 हानि और कई प्रकार के कैंसर में खराब पूर्वानुमान के साथ जुड़ा हुआ है।
- ·It is inferred from allele-specific copy-number patterns, and truncal versus subclonal timing matters.
इन जीनों को मार्ग संदर्भ में रखें
अक्सर पूछे जाने वाले प्रश्न
क्या संपूर्ण-जीनोम दोहरीकरण को सीधे मापा जाता है?
नहीं। इसका अनुमान एलील-विशिष्ट प्रतिलिपि-संख्या पैटर्न से लगाया जाता है - दो या अधिक की प्रमुख-एलील गणना के साथ जीनोम का अंश - सीधे गिना जाने के बजाय।
क्या संपूर्ण-जीनोम दोहरीकरण के लिए टीपी53 उत्परिवर्तन की आवश्यकता होती है?
यह टीपी53 हानि के साथ दृढ़ता से जुड़ा हुआ है, जो असामान्य गुणसूत्र संख्या के साथ प्रसार में बाधा को हटा देता है, लेकिन दोगुने ट्यूमर का एक बड़ा हिस्सा टीपी53 जंगली-प्रकार का होता है, जिसके बजाय अक्सर दोषपूर्ण जी1 गिरफ्तारी होती है।
संपूर्ण-जीनोम दोहरीकरण से पूर्वानुमान क्यों खराब हो जाता है?
प्रत्येक जीन बफर की चार प्रतियां बाद में कार्य-क्षरण उत्परिवर्तन और गुणसूत्र हानि, अधिक जीनोमिक अस्थिरता की अनुमति देती हैं; यह घटना स्वतंत्र रूप से कई ट्यूमर प्रकारों में खराब परिणामों की भविष्यवाणी करती है।
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