हेटेरोज़ायोसिटी का एचएलए नुकसान: प्रस्तुति प्रदर्शनों की सूची का आधा हिस्सा खोना
एचएलए वर्ग I जीन मानव जीनोम में सबसे अधिक बहुरूपी हैं, और अधिकांश लोगों को प्रत्येक माता-पिता से अलग-अलग एलील विरासत में मिलते हैं। ट्यूमर एचएलए लोकस पर एक पैतृक हैप्लोटाइप को नष्ट कर सकता है, हेटेरोज़ायोसिटी के नुकसान का एक रूप जो एमएचसी वर्ग I को पूरी तरह से समाप्त किए बिना आधे एंटीजन-प्रस्तुति प्रदर्शनों को हटा देता है।
त्वरित उत्तर
एचएलए वर्ग I जीन मानव जीनोम में सबसे अधिक बहुरूपी हैं, और अधिकांश लोगों को प्रत्येक माता-पिता से अलग-अलग एलील विरासत में मिलते हैं। ट्यूमर एचएलए लोकस पर एक पैतृक हैप्लोटाइप को नष्ट कर सकता है, हेटेरोज़ायोसिटी के नुकसान का एक रूप जो एमएचसी वर्ग I को पूरी तरह से समाप्त किए बिना आधे एंटीजन-प्रस्तुति प्रदर्शनों को हटा देता है।
विषय समूह का हिस्सा
इम्यूनो-ऑन्कोलॉजी और ट्यूमर मेटाबॉलिज्म
संपूर्ण 15-लेख मार्गदर्शिका खोलेंकुल हानि से भी सूक्ष्म पलायन
एक एचएलए हैप्लोटाइप रखने से ट्यूमर कोशिका को कुछ एंटीजन प्रस्तुति बनाए रखने की सुविधा मिलती है, जिससे एमएचसी वर्ग I के पूर्ण नुकसान के बाद होने वाले प्राकृतिक किलर सेल हमले से बचा जा सकता है, जबकि हटाए गए एलील तक सीमित किसी भी नियोएंटीजन को पेश करने की क्षमता कम हो जाती है।
फेफड़े के कैंसर के एक अध्ययन में, हेटेरोज़ायोसिटी का एचएलए नुकसान ट्यूमर के एक बड़े हिस्से में मौजूद था और अक्सर सबक्लोनल था, यह दर्शाता है कि यह एक प्रारंभिक घटना के बजाय प्रतिरक्षा दबाव के लिए चल रहा अनुकूलन है।
इसे चूकना आसान क्यों है
मानक प्रतिलिपि-संख्या उपकरण एचएलए लोकस पर संघर्ष करते हैं क्योंकि यह क्षेत्र इतना बहुरूपी है और विभिन्न जीनों के अनुक्रम समान हैं। एलील-विशिष्ट हानि को विश्वसनीय रूप से कॉल करने के लिए रोगी के जर्मलाइन एचएलए प्रकार का उपयोग करने वाले समर्पित एल्गोरिदम की आवश्यकता होती है।
इसका मतलब है कि हेटेरोज़ायोसिटी का एचएलए नुकसान मौजूद हो सकता है लेकिन एक नियमित ट्यूमर पैनल द्वारा रिपोर्ट नहीं किया गया है।
नियोएंटीजन भविष्यवाणी के परिणाम
नियोएंटीजन भविष्यवाणी पाइपलाइनें मानती हैं कि एक ट्यूमर किसी व्यक्ति के सभी एचएलए एलील्स पर पेप्टाइड्स पेश कर सकता है। यदि एक हैप्लोटाइप हटा दिया जाता है, तो उन एलील्स के खिलाफ भविष्यवाणियां अस्पष्ट हो जाती हैं, और ट्यूमर का वास्तविक प्रस्तुत करने योग्य प्रदर्शन जितना दिखता है उससे छोटा होता है।
एचएलए हानि के लिए लेखांकन से अनुमानित इम्यूनोजेनेसिटी और वास्तविक प्रतिरक्षा दबाव के बीच संबंध में सुधार होता है, लेकिन यह शोधन अब तक ज्यादातर एक शोध तकनीक है।
यह व्यवहार में कहां बैठता है
नियमित ऑन्कोलॉजी में हेटेरोज़ायोसिटी के एचएलए नुकसान का परीक्षण नहीं किया जाता है, और इस पर कोई उपचार नहीं चुना जाता है। इसका मुख्य मूल्य व्याख्यात्मक है: यह एक कारण है कि उच्च अनुमानित नियोएंटीजन लोड और दृश्यमान टी-सेल घुसपैठ वाला ट्यूमर अभी भी प्रतिरक्षा से बच सकता है और चेकपॉइंट अवरोधक को विफल कर सकता है।
नियोएंटीजन-निर्देशित परीक्षणों के लिए यह अधिक मायने रखता है, क्योंकि हटाए गए एलील तक सीमित पेप्टाइड के उद्देश्य से एक टीका या टी-सेल उत्पाद निष्क्रिय होगा। अनुसंधान पाइपलाइनों में इस कारण से एलील-विशिष्ट एचएलए कॉलिंग तेजी से शामिल हो रही है, और वही जानकारी यह समझाने में मदद करती है कि ट्यूमर के भीतर प्रतिरक्षा दबाव असमान क्यों है।
मुख्य बातें
- ·हेटेरोज़ायोसिटी के एचएलए नुकसान से एक पैतृक एचएलए हैप्लोटाइप नष्ट हो जाता है, जिससे एंटीजन प्रस्तुति कम हो जाती है।
- ·It retains partial MHC class I, avoiding natural killer cell attack, and is often subclonal.
- ·It requires specialised detection and, when present, shrinks the tumour's real neoantigen repertoire.
इन जीनों को मार्ग संदर्भ में रखें
अक्सर पूछे जाने वाले प्रश्न
हेटेरोज़ायोसिटी का एचएलए नुकसान बी2एम नुकसान से किस प्रकार भिन्न है?
बी2एम हानि सभी एमएचसी वर्ग I को हटा देती है; हेटेरोज़ायोसिटी का एचएलए नुकसान एक पैतृक हैप्लोटाइप को नष्ट कर देता है, आंशिक प्रस्तुति को बनाए रखता है, प्राकृतिक किलर सेल हमले से बचता है, और केवल खोए हुए एलील तक सीमित नियोएंटीजन को छोड़ देता है।
एक नियमित ट्यूमर पैनल इसे क्यों भूल सकता है?
एचएलए क्षेत्र अत्यंत बहुरूपी है और जीन अनुक्रम में समान हैं, इसलिए मानक प्रतिलिपि-संख्या उपकरण वहां संघर्ष करते हैं। इसे विश्वसनीय रूप से कॉल करने के लिए रोगी के जर्मलाइन एचएलए प्रकार का उपयोग करने वाले समर्पित एल्गोरिदम की आवश्यकता होती है।
क्या यह नवजात प्रतिजन भविष्यवाणी को प्रभावित करता है?
हाँ। पूर्वानुमान पाइपलाइनें मानती हैं कि किसी व्यक्ति के सभी एचएलए एलील्स उपलब्ध हैं; यदि एक हैप्लोटाइप हटा दिया जाता है, तो ट्यूमर का वास्तविक प्रस्तुत करने योग्य प्रदर्शन अनुमान से छोटा होता है।
सन्दर्भ
- 1फेफड़ों के कैंसर के विकास में एलील-विशिष्ट एचएलए हानि और प्रतिरक्षा पलायन. सेल, 2017. PubMed
- 2पैन-कैंसर इम्युनोजेनिक विश्लेषण जीनोटाइप-इम्यूनोफेनोटाइप संबंधों और चेकपॉइंट नाकाबंदी की प्रतिक्रिया के भविष्यवक्ताओं को प्रकट करते हैं. सेल प्रतिनिधि, 2017. PubMed
- 3कैंसर इम्यूनोथेरेपी में बायोमार्कर के रूप में ट्यूमर उत्परिवर्तनीय बोझ. नेट रेव क्लिन ओंकोल, 2019. PubMed
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