SETD2:H3K36 甲基化、转录和修复
SETD2 是唯一一种在赖氨酸 36 (H3K36me3) 处产生组蛋白 H3 三甲基化的酶,这是活跃转录基因体内沉积的标记。 SETD2 缺失是透明细胞肾细胞癌中反复发生的事件,并出现在神经胶质瘤、白血病和其他肿瘤中。
快速解答
SETD2 是唯一一种在赖氨酸 36 (H3K36me3) 处产生组蛋白 H3 三甲基化的酶,这是活跃转录基因体内沉积的标记。 SETD2 缺失是透明细胞肾细胞癌中反复发生的事件,并出现在神经胶质瘤、白血病和其他肿瘤中。
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癌症表观遗传学和染色质调节因子
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当 RNA 聚合酶 II 穿过基因时,SETD2 放置 H3K36me3。该标记由调节共转录剪接的蛋白质读取,抑制基因体内的虚假转录,并招募促进同源重组的错配修复机制和因子。
因为涉及转录和修复,SETD2 完全丢失具有多效性效应:剪接改变、轻微突变表型和复制时间变化。
透明细胞肾细胞癌
SETD2 与 VHL、PBRM1 和 BAP1 一起位于染色体 3p 上。在大多数透明细胞肾细胞癌中,3p 区域早期丢失,并且在极少数病例中,第二次打击会使剩余的 SETD2 等位基因失活。
SETD2 在这种情况下的缺失与某些系列中更具侵袭性的疾病特征相关,并且机制研究将其与其他途径中 Wnt/β-catenin 信号传导的激活联系起来。
解读
SETD2 改变被报告为肿瘤发现;目前还没有确定的种系癌症综合征,也没有批准的靶向治疗。目前它的主要价值是作为肾肿瘤或其他肿瘤分子肖像的一部分。
与其他大染色质基因一样,区分驱动截短突变和乘客突变需要临床和基因组背景。
肾癌背景和研究方向
在透明细胞肾细胞癌中,SETD2 是一组 3p 号染色体染色质基因(包括 VHL、PBRM1 和 BAP1)之一,它们的组合塑造了肿瘤行为。 SETD2 缺失和 BAP1 缺失在某些系列中与更差的结果相关,这就是为什么即使没有靶向药物,这些基因也会在肾肿瘤面板上一起报告。
研究方向包括利用 H3K36me3 丢失后的轻度同源重组和错配修复缺陷,以及针对 SETD2 无效模型中描述的代谢和 Wnt 信号传导的改变。目前还没有一种疗法转化为批准的疗法。
要点
- ·SETD2 是 H3K36me3 的唯一编写者,将转录延伸与剪接和 DNA 修复联系起来。
- ·它与 VHL、PBRM1 和 BAP1 位于 3p 染色体上,并且在透明细胞肾癌的亚型中丢失。
- ·SETD2 状态目前是描述性的,没有种系综合征或批准的靶向治疗。
将这些基因置于通路背景中
常见问题解答
SETD2 突变会改变治疗吗?
目前没有。尚无获批的 SETD2 靶向疗法,且无种系癌症综合征;这一发现是肾脏或其他肿瘤分子肖像的一部分。
为什么 SETD2 缺失在肾癌中特别常见?
SETD2 位于染色体 3p 上,紧邻 VHL、PBRM1 和 BAP1。 3p 区域在大多数透明细胞肾细胞癌的早期就丢失了,第二次打击就会使子集中剩余的 SETD2 等位基因失活。
H3K36me3 标记有什么作用?
它位于活性基因的整个身体中,有助于调节剪接,抑制虚假的内部转录,并招募错配修复和同源重组因子,因此完全丢失具有广泛的影响。
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