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癌症生物学· 3 分钟阅读

KMT2D 和 KMT2C:许多癌症中丢失的增强子调节因子

KMT2D 和 KMT2C(也称为 MLL2 和 MLL3)是大型组蛋白甲基转移酶,通过组蛋白 H3 赖氨酸 4 的单甲基化来标记活性增强子。在一系列引人注目的癌症中发现一种或两种功能丧失突变,使它们成为最常见的突变染色质调节因子。

快速解答

KMT2D 和 KMT2C(也称为 MLL2 和 MLL3)是大型组蛋白甲基转移酶,通过组蛋白 H3 赖氨酸 4 的单甲基化来标记活性增强子。在一系列引人注目的癌症中发现一种或两种功能丧失突变,使它们成为最常见的突变染色质调节因子。

KMT2D 和 KMT2C:许多癌症中丢失的增强子调节因子:机制和解释图三个相连的阶段总结了文章的机制、测量的效果和解释边界。TP53·CDKN2A·KRAS1标记活性增强剂机制2突变发生的地方观察到的后果3解释说明在上下文中解释基因或通路证据 → 测量的表型 → 检测感知结论
机制图:文章的主要生物学阶段与最终解释是分开的,因此通路关系不会被误认为是临床结论。

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癌症表观遗传学和染色质调节因子

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标记活性增强剂

增强子是促进其靶基因转录的远端调控元件。 KMT2D 和 KMT2C 在 COMPASS 样复合物中,在激活时将 H3K4me1 沉积在增强子处,并支持招募添加 H3K27ac 的组蛋白乙酰转移酶。

当这些酶丢失时,在给定细胞类型中应该开启的增强子就会被激活不足,从而削弱正常的转录程序,并且在许多情况下,有利于分化程度较低的状态。

突变发生的地方

KMT2D 缺失是滤泡性淋巴瘤的一个明确的早期事件,常见于弥漫性大 B 细胞淋巴瘤、膀胱癌、肺鳞状细胞癌、头颈癌和髓母细胞瘤。 KMT2C 在乳腺癌、前列腺癌和其他癌症中反复突变。

突变通常被截断并分布在整个基因中,与肿瘤抑制因子功能丧失模式一致,而不是热点致癌变化。

解释说明

由于 KMT2C 和 KMT2D 是非常大的基因,它们会积累乘客突变,并且并非每个截短变体都是给定肿瘤的驱动因素。种系 KMT2D 变异会导致歌舞伎综合症,这是一种发育障碍,与癌症中的体细胞损失截然不同。

目前还没有批准的直接针对 KMT2C 或 KMT2D 损失的疗法,尽管恢复增强子活性(例如通过调节相反的 H3K27 甲基化)是一个研究领域。

它为肿瘤概况添加了什么

KMT2C 或 KMT2D 损失很少会单独改变治疗,但它会提供背景信息。增强子-调节子的缺失与分化程度较低的肿瘤表型相关,在膀胱癌和肺鳞癌中,这些突变是这些疾病特征的广泛染色质重塑破坏的一部分。

初步实验室证据表明,KMT2D 缺陷型肿瘤可能对某些药物(包括 KDM 去甲基酶抑制剂)更敏感,但没有任何临床证据。目前,其价值主要在于解释肿瘤生物学,以及当变异看起来是种系时标记可能的歌舞伎综合症背景。

要点

  • ·KMT2D 和 KMT2C 写入标记活跃增强子的 H3K4me1 标记。
  • ·截短功能丧失突变在淋巴瘤和许多上皮癌中很常见。
  • ·它们的大尺寸意味着乘客突变很常见,并且驾驶员状态取决于环境。

将这些基因置于通路背景中

常见问题解答

每个截短的 KMT2D 或 KMT2C 突变都是癌症驱动因素吗?

不会。这两个基因都非常大,并且会积累乘客突变,因此驱动状态取决于肿瘤类型和基因组背景,而不是仅取决于截短变体的存在。

是否有针对 KMT2D 或 KMT2C 损失的药物?

目前没有。研究正在探索恢复增强子活性的方法,例如通过调节相反的 H3K27 甲基化,但尚未获得批准。

种系 KMT2D 变体是什么意思?

种系功能丧失的 KMT2D 变异会导致 Kabuki 综合征,这是一种与肿瘤中体细胞 KMT2D 丧失不同的临床背景的发育障碍。

参考文献

  1. 1癌症驱动基因 IDH1/2、JARID1C/KDM5C 和 UTX/KDM6A:组蛋白去甲基化和缺氧重编程之间的串扰. 实验分子医学, 2019. PubMed
  2. 2癌症标志:新维度. 癌症发现, 2022. PubMed
  3. 3癌症的标志:下一代. 细胞, 2011. PubMed

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