癌症表观遗传学和染色质调节因子
表观遗传系统控制哪些基因可以在不改变 DNA 序列的情况下访问。癌症可以改变写入、擦除或读取染色质标记的酶、移动核小体的复合物以及 DNA 甲基化本身的分布。
快速回答
表观遗传变化不会自动逆转、可靶向或由单一突变引起。解释首先要分离改变的层——DNA甲基化、组蛋白标记、染色质复合物或谱系程序——然后询问如何测量它。
集群如何组合在一起
关键基因谱
表观遗传学和染色质库
跟踪染色质标记从机制到疾病背景和新兴治疗策略。
克隆造血中的 DNMT3A 和 TET2
DNA 甲基化调节因子 DNMT3A 和 TET2 中与年龄相关的突变如何扩大血细胞克隆,不确定潜力的克隆造血意味着什么,及其已知风险。
3 分钟阅读癌症中的 EZH2 和 Polycomb 抑制
EZH2(多梳抑制复合物 2 的酶核心)如何通过 H3K27 甲基化沉默基因,为什么它可以充当癌基因或肿瘤抑制因子,以及在何处使用抑制剂。
3 分钟阅读KMT2D 和 KMT2C:许多癌症中丢失的增强子调节因子
为什么组蛋白甲基转移酶 KMT2D 和 KMT2C 是癌症中最常见的突变基因,它们如何标记活性增强子,以及丢失意味着什么。
3 分钟阅读KDM6A (UTX):X 连锁组蛋白去甲基化酶肿瘤抑制剂
KDM6A 如何去除抑制性 H3K27me3 标记,为什么它在 X 染色体上的位置会导致某些癌症的性别差异,以及它的缺失在哪里常见。
3 分钟阅读SETD2:H3K36 甲基化、转录和修复
SETD2 如何写入指导转录、剪接和 DNA 修复的 H3K36me3 标记,以及为什么它的丢失在透明细胞肾细胞癌和其他癌症中经常发生。
3 分钟阅读BAP1 肿瘤易感综合征
种系 BAP1 缺失如何诱发间皮瘤、葡萄膜黑色素瘤、肾细胞癌和独特的皮肤肿瘤,以及体细胞 BAP1 缺失如何用于病理学。
3 分钟阅读组蛋白 H3 K27M 和弥漫性中线胶质瘤
组蛋白 H3 中的单个赖氨酸到蛋氨酸的变化如何重新编程弥漫性中线神经胶质瘤的表观基因组,为什么它定义了肿瘤类型,以及正在尝试的治疗方法。
3 分钟阅读儿童高级别胶质瘤中的组蛋白 H3 G34 突变
组蛋白 H3.3 中的甘氨酸 34 取代如何定义一组不同的半球儿科高级神经胶质瘤,它们与 K27M 有何不同,以及它们对染色质和修复的影响。
3 分钟阅读BET 布罗莫结构域抑制剂:针对转录成瘾
BRD4 等 BET 蛋白如何读取乙酰化组蛋白以驱动 MYC 等基因的转录、开发 BET 抑制剂的原因以及试验中遇到的挑战。
3 分钟阅读HDAC 抑制剂在癌症中的作用:它们在哪里起作用,在哪里不起作用
组蛋白脱乙酰酶抑制剂如何改变基因表达,为什么它们主要被批准用于 T 细胞淋巴瘤和骨髓瘤,以及为什么它们在实体瘤中表现不佳。
3 分钟阅读癌症中的 DNA 甲基化:沉默和不稳定性
癌症如何将沉默肿瘤抑制基因的局灶性启动子高甲基化与全基因组低甲基化相结合,以及如何使用甲基化进行分类和检测。
3 分钟阅读CpG 岛甲基化表型 (CIMP)
当肿瘤具有广泛的协调启动子甲基化时意味着什么,CIMP 如何与结直肠癌中的 BRAF 突变和 MLH1 沉默相关,以及它作为一个类别的局限性。
3 分钟阅读Menin-KMT2A 抑制剂治疗急性白血病
KMT2A 重排和 NPM1 突变如何产生对 menin-KMT2A 相互作用的依赖性,以及 revumenib 等 menin 抑制剂如何利用它。
3 分钟阅读SMARCB1 丢失和横纹肌样肿瘤
尽管基因组近乎沉默,但 SWI/SNF 亚基 SMARCB1 的缺失如何导致横纹肌样肿瘤、与横纹肌样易感综合征的联系以及它产生的 EZH2 依赖性。
3 分钟阅读去甲基化剂:阿扎胞苷和地西他滨
阿扎胞苷和地西他滨如何消耗 DNMT 酶以逆转异常 DNA 甲基化,它们在骨髓疾病中的应用,以及为什么反应需要数月时间。
3 分钟阅读常见问题解答
遗传变化和表观遗传变化有什么区别?
基因改变改变了 DNA 序列或结构;表观遗传变化改变了 DNA 的包装或调节方式,但不一定改变其序列。
启动子甲基化总是关闭基因吗?
不会。基因组区域、测定、截止值、细胞混合物以及甲基化和表达之间的关系都会影响解释。
所有染色质调节突变都是可靶向的吗?
不。有些创建了既定的治疗背景,而许多仍然是生物标志物或研究假设,而不是经过验证的治疗生物标志物。