SETD2: H3K36 मिथाइलेशन, ट्रांसक्रिप्शन और मरम्मत
SETD2 एकमात्र एंजाइम है जो लाइसिन 36 (H3K36me3) पर हिस्टोन H3 का त्रि-मिथाइलेशन उत्पन्न करता है, जो सक्रिय रूप से प्रतिलेखित जीन के शरीर में जमा हुआ एक निशान है। SETD2 का नुकसान क्लियर सेल रीनल सेल कार्सिनोमा में एक आवर्ती घटना है और ग्लियोमास, ल्यूकेमिया और अन्य ट्यूमर में दिखाई देता है।
त्वरित उत्तर
SETD2 एकमात्र एंजाइम है जो लाइसिन 36 (H3K36me3) पर हिस्टोन H3 का त्रि-मिथाइलेशन उत्पन्न करता है, जो सक्रिय रूप से प्रतिलेखित जीन के शरीर में जमा हुआ एक निशान है। SETD2 का नुकसान क्लियर सेल रीनल सेल कार्सिनोमा में एक आवर्ती घटना है और ग्लियोमास, ल्यूकेमिया और अन्य ट्यूमर में दिखाई देता है।
विषय समूह का हिस्सा
कैंसर एपिजेनेटिक्स और क्रोमैटिन रेगुलेटर
संपूर्ण 15-लेख मार्गदर्शिका खोलेंएक निशान, अनेक नौकरियाँ
H3K36me3 को SETD2 द्वारा रखा गया है क्योंकि RNA पोलीमरेज़ II एक जीन के माध्यम से चलता है। चिह्न को प्रोटीन द्वारा पढ़ा जाता है जो सह-ट्रांसक्रिप्शनल स्प्लिसिंग को नियंत्रित करता है, जीन निकायों के भीतर से नकली ट्रांसक्रिप्शन को दबाता है, और बेमेल-मरम्मत मशीनरी और कारकों को भर्ती करता है जो सजातीय पुनर्संयोजन को बढ़ावा देते हैं।
क्योंकि यह प्रतिलेखन और मरम्मत को छूता है, पूर्ण SETD2 हानि में प्लियोट्रोपिक प्रभाव होते हैं: परिवर्तित स्प्लिसिंग, एक हल्के उत्परिवर्ती फेनोटाइप और प्रतिकृति समय में परिवर्तन।
क्लियर सेल रीनल सेल कार्सिनोमा
SETD2 VHL, PBRM1 और BAP1 के साथ गुणसूत्र 3p पर बैठता है। अधिकांश स्पष्ट सेल रीनल सेल कार्सिनोमस में 3p क्षेत्र जल्दी ही नष्ट हो जाता है, और फिर एक दूसरा हिट काफी कम मामलों में शेष SETD2 एलील को निष्क्रिय कर देता है।
इस सेटिंग में SETD2 हानि कुछ श्रृंखलाओं में अधिक आक्रामक रोग विशेषताओं से जुड़ी हुई है, और यंत्रवत कार्य इसे अन्य मार्गों के बीच Wnt/बीटा-कैटेनिन सिग्नलिंग के सक्रियण से जोड़ता है।
व्याख्या
एक SETD2 परिवर्तन को ट्यूमर खोज के रूप में रिपोर्ट किया गया है; कोई स्थापित जर्मलाइन कैंसर सिंड्रोम नहीं है और कोई अनुमोदित लक्षित चिकित्सा नहीं है। वर्तमान में इसका मुख्य मूल्य गुर्दे या अन्य ट्यूमर के आणविक चित्र के हिस्से के रूप में है।
अन्य बड़े क्रोमैटिन जीन की तरह, एक यात्री से ड्राइवर ट्रंकेटिंग उत्परिवर्तन को अलग करने के लिए नैदानिक और जीनोमिक संदर्भ की आवश्यकता होती है।
गुर्दे के कैंसर का संदर्भ और अनुसंधान दिशा-निर्देश
क्लियर सेल रीनल सेल कार्सिनोमा में, SETD2 क्रोमोसोम-3पी क्रोमैटिन जीन के एक समूह में से एक है - वीएचएल, पीबीआरएम1 और बीएपी1 के साथ - जिसका संयोजन ट्यूमर के व्यवहार को आकार देता है। BAP1 हानि के साथ SETD2 हानि को कुछ श्रृंखलाओं में बदतर परिणामों से जोड़ा गया है, यही कारण है कि इन जीनों को लक्षित दवा के बिना भी गुर्दे के ट्यूमर पैनल पर एक साथ रिपोर्ट किया जाता है।
अनुसंधान निर्देशों में हल्के समरूप-पुनर्संयोजन और बेमेल-मरम्मत दोषों का फायदा उठाना शामिल है जो H3K36me3 हानि के बाद होते हैं, और SETD2-null मॉडल में वर्णित परिवर्तित चयापचय और Wnt सिग्नलिंग को लक्षित करते हैं। किसी ने भी अनुमोदित चिकित्सा में अनुवाद नहीं किया है।
मुख्य बातें
- ·SETD2 H3K36me3 का एकमात्र लेखक है, जो प्रतिलेखन बढ़ाव को स्प्लिसिंग और डीएनए मरम्मत से जोड़ता है।
- ·It is co-located with VHL, PBRM1 and BAP1 on chromosome 3p and is lost in a subset of clear cell renal cancers.
- ·SETD2 स्थिति वर्तमान में वर्णनात्मक है, बिना जर्मलाइन सिंड्रोम या अनुमोदित लक्षित उपचार के।
इन जीनों को मार्ग संदर्भ में रखें
अक्सर पूछे जाने वाले प्रश्न
क्या SETD2 उत्परिवर्तन से उपचार बदल जाता है?
फिलहाल नहीं। कोई अनुमोदित SETD2-लक्षित थेरेपी नहीं है और कोई जर्मलाइन कैंसर सिंड्रोम नहीं है; यह खोज गुर्दे या अन्य ट्यूमर के आणविक चित्र का हिस्सा है।
विशेष रूप से गुर्दे के कैंसर में SETD2 हानि आम क्यों है?
SETD2 VHL, PBRM1 और BAP1 के बगल में गुणसूत्र 3p पर बैठता है। अधिकांश स्पष्ट सेल रीनल सेल कार्सिनोमस में 3p क्षेत्र जल्दी ही नष्ट हो जाता है, और फिर एक दूसरा हिट एक उपसमूह में शेष SETD2 एलील को निष्क्रिय कर देता है।
H3K36me3 चिह्न क्या करता है?
इसे सक्रिय जीनों के शरीर में रखा जाता है और स्प्लिसिंग को विनियमित करने, नकली आंतरिक प्रतिलेखन को दबाने और बेमेल-मरम्मत और सजातीय-पुनर्संयोजन कारकों को भर्ती करने में मदद करता है, इसलिए पूर्ण हानि का व्यापक प्रभाव होता है।
सन्दर्भ
- 1कैंसर चालक जीन IDH1/2, JARID1C/KDM5C, और UTX/KDM6A: हिस्टोन डिमेथिलेशन और हाइपोक्सिक रिप्रोग्रामिंग के बीच क्रॉसस्टॉक. ऍक्स्प मोल मेड, 2019. PubMed
- 2SETD2 द्वारा बीटा-कैटेनिन गतिविधि का बहुस्तरीय विनियमन पॉलीसिस्टिक किडनी रोग से क्लियर सेल रीनल सेल कार्सिनोमा में संक्रमण को दबा देता है।. कैंसर रेस, 2021. PubMed
- 3कैंसर के लक्षण: नए आयाम. कैंसर डिस्कोव, 2022. PubMed
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