ट्यूमर की शुद्धता और अनुक्रमण: नमूने में कितना कैंसर है

पवित्रता एक पहचान सीमा क्यों तय करती है

यदि किसी नमूने में केवल 20 प्रतिशत कोशिकाएं ही कैंसर हैं, तो प्रत्येक कैंसर कोशिका में मौजूद एक विषमयुग्मजी उत्परिवर्तन लगभग 10 प्रतिशत अनुक्रमण में दिखाई देगा, क्योंकि आधे ट्यूमर डीएनए प्रतियां इसे ले जाती हैं।

यदि परख की पहचान की सीमा 5 प्रतिशत के आसपास है, तो वह उत्परिवर्तन अभी भी पता लगाने योग्य है; यदि शुद्धता 10 प्रतिशत तक गिर जाती है, तो वही उत्परिवर्तन पता लगाने की सीमा के करीब या नीचे आ जाता है और छूट सकता है।

शुद्धता का अनुमान कैसे लगाया जाता है

पैथोलॉजिस्ट दागदार स्लाइड पर दृश्य रूप से शुद्धता का अनुमान लगाते हैं, लेकिन यह अनुमानित और पर्यवेक्षक पर निर्भर है। जैव सूचनात्मक विधियाँ कई वेरिएंट और कॉपी-संख्या पैटर्न के एलील अंशों का उपयोग करके, अनुक्रमण डेटा से ही शुद्धता का अनुमान लगाती हैं।

दोनों अनुमान हमेशा सहमत नहीं होते हैं, और कम शुद्धता वाले नमूनों का किसी भी विधि से विश्वसनीय विश्लेषण करना कठिन होता है।

विभिन्न निष्कर्षों के परिणाम

कम शुद्धता सबक्लोनल म्यूटेशन, निम्न-स्तरीय कॉपी-संख्या परिवर्तनों और विशेष रूप से, समयुग्मजी विलोपन का पता लगाने को सबसे अधिक प्रभावित करती है, जिसे सामान्य-सेल सिग्नल द्वारा छुपाया जा सकता है।

कम शुद्धता पर ट्यूमर उत्परिवर्तन बोझ और माइक्रोसेटेलाइट अस्थिरता का अनुमान भी कम विश्वसनीय है क्योंकि मापने के लिए ट्यूमर संकेत कम है।

नमूने में सुधार

मैक्रोडिसेक्शन या माइक्रोडिसेक्शन, जहां पैथोलॉजिस्ट निशान लगाता है और प्रयोगशाला स्लाइड के ट्यूमर-समृद्ध क्षेत्र को खुरचती है, प्रभावी शुद्धता बढ़ाती है। अधिक सेलुलर ब्लॉक चुनना, या ताज़ा बायोप्सी का अनुरोध करना, अन्य विकल्प हैं।

प्रयोगशालाएं आमतौर पर न्यूनतम शुद्धता सीमा निर्धारित करती हैं जिसके नीचे वे रिपोर्ट नहीं करेंगे, या एक चेतावनी के साथ रिपोर्ट करेंगे।

व्याख्या नोट्स

एक रिपोर्ट में अनुमानित ट्यूमर सामग्री बताई जानी चाहिए। कम शुद्धता वाले नमूने से नकारात्मक परिणाम वास्तविक अनुपस्थिति का कमजोर सबूत है।

यदि चिकित्सकीय रूप से अपेक्षित उत्परिवर्तन नहीं पाया जाता है और शुद्धता कम है, तो ट्यूमर के नकारात्मक होने का निष्कर्ष निकालने से पहले बेहतर नमूने पर दोबारा परीक्षण की आवश्यकता होती है।

मुख्य बातें

• ·ट्यूमर की शुद्धता एक नमूने में कैंसर कोशिकाओं का अंश और कैप्स डिटेक्शन संवेदनशीलता है।
• ·कम शुद्धता वास्तविक उत्परिवर्तन को परख की पहचान की सीमा से नीचे धकेल सकती है।
• ·समयुग्मक विलोपन और उपक्लोनल परिवर्तन सबसे अधिक प्रभावित होते हैं।
• ·मैक्रोडिसेक्शन और नमूना चयन प्रभावी शुद्धता बढ़ा सकता है।