Recrutement d'essais sur le cancer par gène
L'Oncology Trial Activity Index suit le nombre d'études ClinicalTrials.gov en cours de recrutement qui mentionnent chacun des 37 gènes pertinents pour le cancer. Il s’agit d’un instantané de l’attention de la recherche, et non d’un classement de l’importance biologique ou des avantages du traitement.
Gènes surveillés
37
Avec des études de recrutement
37
Nombre de courant le plus élevé
HER2 · 1 020
Pilote de surveillance au niveau de l'étude
Tracer les enregistrements et comparer les instantanés datés
L'exportation reproductible comprend les identifiants NCT, les liens sources, les dates de mise à jour du registre et les champs dans lesquels chaque symbole de gène a été trouvé. Il s'agit de la première référence stockée, donc aucun ajout ou suppression n'est encore réclamé.
Analyse de cet instantané
Trois guides ciblés transforment le tableau en questions auxquelles il est possible de répondre sans étendre les données au-delà de la recherche dans le registre.
Les dix gènes cancéreux les plus mentionnés
Le classement daté, ce que mesure chaque ligne et pourquoi les décomptes ne peuvent pas être additionnés.
Pourquoi HER2 apparaît actuellement au-dessus de l'EGFR
Comment les synonymes, le langage des biomarqueurs et les champs du registre façonnent le résultat.
Activité d'essai EGFR vs KRAS
Biologie des voies connectées, différentes questions moléculaires et études qui se chevauchent.
Indice d'activité actuelle
Les décomptes sont exacts à la date de l'instantané. Une étude peut mentionner plusieurs gènes, les lignes se chevauchent donc et ne doivent pas être additionnées.
| Rang | Gène | Etudes de recrutement |
|---|---|---|
| 1 | HER2 | 1,020 |
| 2 | EGFR | 696 |
| 3 | KRAS | 311 |
| 4 | KIT | 218 |
| 5 | CDK4 | 180 |
| 6 | RB1 | 161 |
| 7 | BRAF | 156 |
| 8 | BCL2 | 125 |
| 9 | BRCA1 | 109 |
| 10 | TP53 | 102 |
| 11 | VEGFA | 95 |
| 12 | BRCA2 | 75 |
| 13 | APC | 65 |
| 14 | IDH1 | 59 |
| 15 | PIK3CA | 56 |
| 16 | MTOR | 50 |
| 17 | MGMT | 46 |
| 18 | ATM | 45 |
| 19 | PALB2 | 42 |
| 20 | POLE | 42 |
| 21 | MYC | 39 |
| 22 | PTEN | 37 |
| 23 | CDKN2A | 36 |
| 24 | MSH2 | 33 |
| 25 | MTAP | 33 |
| 26 | MLH1 | 31 |
| 27 | EZH2 | 27 |
| 28 | MDM2 | 14 |
| 29 | STAT3 | 14 |
| 30 | CHEK2 | 13 |
| 31 | AKT1 | 12 |
| 32 | ATRX | 8 |
| 33 | HIF1A | 5 |
| 34 | SMARCB1 | 2 |
| 35 | DAXX | 1 |
| 36 | KMT2D | 1 |
| 37 | MUTYH | 1 |
Méthode et limites
GeneAnalyses interroge l'API ClinicalTrials.gov v2 séparément pour chaque gène sélectionné, avec la condition définie sur cancer et le statut global défini sur recrutement. Une commande éditoriale explicite stocke les enregistrements d'étude supprimés sous forme d'instantané daté et versionné ; les versions de production ordinaires consomment cet instantané validé plutôt que de modifier silencieusement l'ensemble de données.
Les enregistrements d'exportation où une mention exacte d'un symbole de gène apparaît dans les champs de titre, de description, de condition, d'intervention, d'éligibilité ou de résultat renvoyés. ClinicalTrials.gov peut également renvoyer une correspondance de son index de recherche qui n'est pas présente dans ces champs exportés ; ces enregistrements sont étiquetés en conséquence plutôt que de se voir attribuer un champ deviné.
Un symbole peut apparaître comme un biomarqueur, un critère d'éligibilité, un critère d'évaluation exploratoire, un concept de base ou une cible de traitement. Les décomptes mesurent donc les correspondances de recherche dans le registre, et non les résultats positifs, les approbations, le nombre de patients, la prévalence ou l'importance clinique. L'ambiguïté des symboles génétiques et les synonymes peuvent affecter la recherche de texte, et une étude peut apparaître sous plusieurs gènes.
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