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Epigenética del cáncer y reguladores de la cromatina

Los sistemas epigenéticos controlan qué genes son accesibles sin cambiar la secuencia del ADN. El cáncer puede alterar las enzimas que escriben, borran o leen marcas y los complejos que reorganizan la cromatina.

Respuesta rápida

Un cambio epigenético no es automáticamente reversible, tratable ni causado por una sola mutación. Primero hay que distinguir la capa alterada y después comprobar cómo se midió.

Cómo se relacionan los conceptos

01
Escribir y borrar marcas
Las enzimas DNMT, TET, KMT y KDM modifican marcas del ADN o de histonas que influyen en la transcripción.
02
Mover y compactar cromatina
Los complejos SWI/SNF y Polycomb organizan el acceso al ADN regulador y pueden ejercer funciones opuestas.
03
Conectar con el tratamiento
Los agentes hipometilantes y los inhibidores de HDAC, EZH2, BET o menina actúan en nodos distintos.

Perfiles de genes clave

Biblioteca de epigenética y cromatina

De las marcas de cromatina al contexto de enfermedad y las estrategias terapéuticas.

Los artículos especializados enlazados a continuación están disponibles en inglés.

01

DNMT3A y TET2 en hematopoyesis clonal

Cómo las mutaciones relacionadas con la edad en los reguladores de metilación del ADN DNMT3A y TET2 amplían los clones de células sanguíneas, qué significa la hematopoyesis clonal de potencial indeterminado y sus riesgos conocidos.

3 minutos de lectura
02

EZH2 y represión de Polycomb en el cáncer

Cómo EZH2, el núcleo enzimático del complejo represivo 2 de Polycomb, silencia genes mediante la metilación de H3K27, por qué puede actuar como un oncogén o supresor de tumores y dónde se utilizan inhibidores.

3 minutos de lectura
03

KMT2D y KMT2C: reguladores potenciadores perdidos en muchos cánceres

Por qué las histonas metiltransferasas KMT2D y KMT2C se encuentran entre los genes mutados con mayor frecuencia en el cáncer, cómo marcan potenciadores activos y qué significa la pérdida para la interpretación.

3 minutos de lectura
04

KDM6A (UTX): un supresor tumoral de histona desmetilasa ligada al cromosoma X

Cómo KDM6A elimina la marca represiva H3K27me3, por qué su ubicación en el cromosoma X contribuye a las diferencias de sexo en algunos cánceres y dónde es común su pérdida.

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05

SETD2: Metilación, transcripción y reparación de H3K36

Cómo SETD2 escribe la marca H3K36me3 que guía la transcripción, el empalme y la reparación del ADN, y por qué su pérdida es un evento recurrente en el carcinoma de células renales de células claras y otros cánceres.

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06

Síndrome de predisposición tumoral BAP1

Cómo la pérdida de BAP1 de la línea germinal predispone al mesotelioma, melanoma uveal, carcinoma de células renales y tumores cutáneos distintivos, y cómo se utiliza la pérdida de BAP1 somática en patología.

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07

Histona H3 K27M y glioma difuso de línea media

Cómo un único cambio de lisina a metionina en la histona H3 reprograma el epigenoma del glioma difuso de la línea media, por qué define el tipo de tumor y qué se está probando terapéuticamente.

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08

Mutaciones de la histona H3 G34 en glioma pediátrico de alto grado

Cómo las sustituciones de glicina-34 en la histona H3.3 definen un grupo distinto de gliomas hemisféricos pediátricos de alto grado, en qué se diferencian del K27M y su efecto sobre la cromatina y la reparación.

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09

Inhibidores del bromodominio BET: dirigidos a la adicción transcripcional

Cómo las proteínas BET, como BRD4, leen las histonas acetiladas para impulsar la transcripción de genes como MYC, por qué se desarrollaron inhibidores BET y los desafíos observados en los ensayos.

3 minutos de lectura
10

Inhibidores de HDAC en el cáncer: dónde funcionan y dónde no

Cómo los inhibidores de la histona desacetilasa cambian la expresión genética, por qué están aprobados principalmente en linfomas de células T y mieloma, y ​​por qué han tenido un rendimiento inferior en tumores sólidos.

3 minutos de lectura
11

Metilación del ADN en el cáncer: silenciamiento e inestabilidad

Cómo los cánceres combinan la hipermetilación del promotor focal que silencia los supresores de tumores con la hipometilación de todo el genoma, y ​​cómo se utiliza la metilación para la clasificación y detección.

3 minutos de lectura
12

El fenotipo metilador de isla CpG (CIMP)

Qué significa cuando un tumor tiene una metilación coordinada generalizada del promotor, cómo se relaciona CIMP con la mutación BRAF y el silenciamiento de MLH1 en el cáncer colorrectal y sus límites como categoría.

3 minutos de lectura
13

Inhibidores de Menin-KMT2A en la leucemia aguda

Cómo los reordenamientos de KMT2A y las mutaciones de NPM1 crean una dependencia de la interacción menina-KMT2A, y cómo los inhibidores de menina como revumenib la explotan.

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14

Pérdida de SMARCB1 y tumores rabdoides

Cómo la pérdida de la subunidad SWI/SNF SMARCB1 causa tumores rabdoides a pesar de un genoma casi silencioso, el vínculo con el síndrome de predisposición rabdoide y la dependencia de EZH2 que crea.

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15

Agentes hipometilantes: azacitidina y decitabina

Cómo la azacitidina y la decitabina agotan las enzimas DNMT para revertir la metilación aberrante del ADN, dónde se utilizan en la enfermedad mieloide y por qué la respuesta tarda meses.

3 minutos de lectura

Preguntas frecuentes

¿Qué diferencia hay entre un cambio genético y uno epigenético?

El cambio genético altera la secuencia o estructura del ADN; el epigenético modifica su empaquetamiento o regulación sin cambiar necesariamente la secuencia.

¿La metilación de un promotor siempre apaga un gen?

No. La región, el ensayo, el umbral, la mezcla celular y la relación con la expresión condicionan la interpretación.

¿Todas las mutaciones de reguladores de cromatina son tratables?

No. Algunas tienen contextos terapéuticos establecidos, pero muchas siguen siendo marcadores biológicos o hipótesis de investigación.