通过基因招募癌症试验
肿瘤学试验活动指数追踪目前正在招募的 ClinicalTrials.gov 研究中提到了 37 个癌症相关基因的数量。这是一个研究关注度快照,而不是生物学重要性或治疗益处的排行榜。
基因监测
37
进行招募研究
37
最高电流计数
HER2·1,020
研究级监测试点
跟踪记录并比较日期快照
可重复的导出包括 NCT 标识符、源链接、注册表更新日期以及找到每个基因符号的字段。 这是第一个存储的基线,因此尚未声明任何添加或删除。
此快照的分析
三个重点指南将表格转化为可回答的问题,而无需将数据扩展到注册表搜索之外。
当前活动指数
计数在快照日期是准确的。一项研究可以提及多个基因,因此行重叠且不得添加在一起。
| 排名 | 基因 | 招募研究 |
|---|---|---|
| 1 | HER2 | 1,020 |
| 2 | EGFR | 696 |
| 3 | KRAS | 311 |
| 4 | KIT | 218 |
| 5 | CDK4 | 180 |
| 6 | RB1 | 161 |
| 7 | BRAF | 156 |
| 8 | BCL2 | 125 |
| 9 | BRCA1 | 109 |
| 10 | TP53 | 102 |
| 11 | VEGFA | 95 |
| 12 | BRCA2 | 75 |
| 13 | APC | 65 |
| 14 | IDH1 | 59 |
| 15 | PIK3CA | 56 |
| 16 | MTOR | 50 |
| 17 | MGMT | 46 |
| 18 | ATM | 45 |
| 19 | PALB2 | 42 |
| 20 | POLE | 42 |
| 21 | MYC | 39 |
| 22 | PTEN | 37 |
| 23 | CDKN2A | 36 |
| 24 | MSH2 | 33 |
| 25 | MTAP | 33 |
| 26 | MLH1 | 31 |
| 27 | EZH2 | 27 |
| 28 | MDM2 | 14 |
| 29 | STAT3 | 14 |
| 30 | CHEK2 | 13 |
| 31 | AKT1 | 12 |
| 32 | ATRX | 8 |
| 33 | HIF1A | 5 |
| 34 | SMARCB1 | 2 |
| 35 | DAXX | 1 |
| 36 | KMT2D | 1 |
| 37 | MUTYH | 1 |
方法和限制
GeneAnalyses 分别查询 ClinicalTrials.gov API v2 中的每个策划基因,条件设置为癌症,总体状态设置为招募。明确的编辑命令将剥离的研究记录存储为带日期、版本化的快照;普通的生产构建会使用已提交的快照,而不是默默地更改数据集。
导出记录,其中返回的标题、描述、条件、干预、资格或结果字段中出现准确的基因符号提及。 ClinicalTrials.gov 还可以从其搜索索引返回那些导出字段中不存在的匹配项;这些记录会被相应地标记,而不是分配一个猜测的字段。
符号可以作为生物标志物、资格标准、探索性终点、背景概念或治疗目标出现。因此,计数衡量的是注册搜索匹配,而不是阳性结果、批准、患者数量、患病率或临床重要性。基因符号歧义和同义词会影响文本搜索,一项研究可能会出现在多个基因下。
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